Author | Resende, Paola Cristina | |
Author | Gräf, Tiago | |
Author | Paixão, Anna Carolina Dias | |
Author | Appolinario, Luciana | |
Author | Lopes, Renata Serrano | |
Author | Mendonça, Ana Carolina da Fonseca | |
Author | Rocha, Alice Sampaio Barreto da | |
Author | Motta, Fernando Couto | |
Author | Neto, Lidio Gonçalves Lima | |
Author | Khouri, Ricardo | |
Author | Oliveira, Camila I. de | |
Author | Muccillo, Pedro Santos | |
Author | Bezerra, João Felipe | |
Author | Teixeira, Dalane Loudal Florentino | |
Author | Riediger, Irina | |
Author | Debur, Maria do Carmo | |
Author | Rodrigues, Rodrigo Ribeiro | |
Author | Leite, Anderson Brandão | |
Author | Santos, Cliomar Alves do | |
Author | Gregianini, Tatiana Schäffer | |
Author | Fernandes, Sandra Bianchini | |
Author | Bernardes, André Felipe Leal | |
Author | Cavalcanti, Andrea Cony | |
Author | Miyajima, Fábio | |
Author | Sachhi, Claudio | |
Author | Mattos, Tirza | |
Author | Costa, Cristiano Fernandes da | |
Author | Delatorre, Edson | |
Author | Wallau, Gabriel L. | |
Author | Naveca, Felipe G. | |
Author | Bello, Gonzalo | |
Author | Siqueira, Marilda Mendonça | |
Access date | 2022-05-11T19:09:10Z | |
Available date | 2022-05-11T19:09:10Z | |
Document date | 2021 | |
Citation | RESENDE, Paola Cristina et al. A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil. Viruses, v. 13, n. 5, p. 1-7, 2021. | pt_BR |
ISSN | 1999-4915 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52621 | |
Description | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ | |
Sponsorship | Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas (FAPEAM). Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq). CNPq/Ministério da Ciência, Tecnologia, Inovações e Comunicações/Ministério da Saúde (MS/FNDCT/SCTIE/Decit). Inova Fiocruz/Fundação Oswaldo Cruz. Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ). | pt_BR |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | MDPI | pt_BR |
Previous version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/47114 | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | SARS-CoV-2 | pt_BR |
Subject in Portuguese | E484K | pt_BR |
Subject in Portuguese | Variante de interesse | pt_BR |
Subject in Portuguese | Epidemiologia genômica | pt_BR |
Subject in Portuguese | Brasil | pt_BR |
Title | A potential SARS-CoV-2 variant of interest (VOI) harboring mutation E484K in the spike protein was identified within lineage B.1.1.33 circulating in Brazil | pt_BR |
Type | Article | |
DOI | 10.3390/v13050724 | |
Abstract | The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) epidemic in Brazil was dominated by two lineages designated as B.1.1.28 and B.1.1.33. The two SARS-CoV-2 variants harboring mutations at the receptor-binding domain of the Spike (S) protein, designated as lineages P.1 and P.2, evolved from lineage B.1.1.28 and are rapidly spreading in Brazil. Lineage P.1 is considered a Variant of Concern (VOC) because of the presence of multiple mutations in the S protein (including K417T, E484K, N501Y), while lineage P.2 only harbors mutation S:E484K and is considered a Variant of Interest (VOI). On the other hand, epidemiologically relevant B.1.1.33 deriving lineages have not been described so far. Here we report the identification of a new SARS-CoV-2 VOI within lineage B.1.1.33 that also harbors mutation S:E484K and was detected in Brazil between November 2020 and February 2021. This VOI displayed four non-synonymous lineage-defining mutations (NSP3:A1711V, NSP6:F36L, S:E484K, and NS7b:E33A) and was designated as lineage N.9. The VOI N.9 probably emerged in August 2020 and has spread across different Brazilian states from the Southeast, South, North, and Northeast regions. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Maranhão. São Luís, MA, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Enfermidades Infecciosas Transmitidas por Vetores. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Plataforma de Vigilância Molecular. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia e Biologia Molecular. Salvador, BA, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal da Paraíba. Escola Técnica de Saúde. Centro de Ciências da Saúde. Laboratório de Vigilância Molecular Aplicada. João Pessoa, PB, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Espírito Santo. Vitoria, ES, Brasil / Universidade Federal do Espírito Santo. Núcleo de Doenças Infecciosas. Vitoria, ES, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Alagoas. Maceió, AL, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Sul. Porto Alegre, RS, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Santa Catarina. Florianópolis, SC, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Fiocruz Ceará. Eusébio, CE, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Instituto Adolfo Lutz. São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Amazonas, Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação de Vigilância em Saúde do Amazonas. Manaus. AM, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Espírito Santo. Departamento de Biologia. Centro de Ciências Exatas, Naturais e da Saúde. Alegre, ES, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Departamento de Entomologia e Núcleo de Bioinformática. Recife, PE, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Leônidas e Maria Deane. Laboratório de Ecologia de Doenças Transmissíveis na Amazônia. Manaus, AM, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Presidência. Rede de Vigilância Genômica Fiocruz COVID-19. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Subject | SARS-CoV-2 | pt_BR |
Subject | E484K | pt_BR |
Subject | Variant of Interest | pt_BR |
Subject | Genomic epidemiology | pt_BR |
Subject | Brazil | pt_BR |
Subject in Spanish | SARS-CoV-2 | pt_BR |
Subject in Spanish | E484K | pt_BR |
Subject in Spanish | Variante de interés | pt_BR |
Subject in Spanish | Epidemiología genómica | pt_BR |
Subject in Spanish | Brasil | pt_BR |
Subject in French | SRAS-CoV-2 | pt_BR |
Subject in French | E484K | pt_BR |
Subject in French | Variante d'intérêt | pt_BR |
Subject in French | Épidémiologie génomique | pt_BR |
Subject in French | Brésil | pt_BR |