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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/66879
SPOLIGOTYPING OF CLINICAL MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLATES FROM THE STATE OF MINAS GERAIS, BRAZIL
Author
Affilliation
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
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Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Departamento de Clínica Médica/Pneumologia, Faculdade de Medicina, Universidade Federal de Minas Gerais, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Desenvolvimento Tecnológico em Saúde. Instituto Nacional de Ciência e Tecnologia de Inovação em Doenças de Populações Negligenciadas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
Realizamos spoligotyping em 114 cepas do complexo Mycobacterium tuberculosis (Mtb) que foram isoladas de pacientes em Unidades de Saúde de Minas Gerais durante 2004. Um total de 82/114 (72%) isolados clínicos foram agrupados e 32/114 (28%) eram únicos. Sete tipos compartilhados contendo nove cepas foram criados recentemente. Um total de nove padrões corresponderam a cepas órfãs não relatadas, conforme avaliado em relação a todas as cepas registradas no banco de dados proprietário SITVIT2 no Institut Pasteur de la Guadeloupe. Os principais clados foram compostos por isolados que pertencem aos seguintes genótipos: América Latina e Mediterrâneo (63/114, 55,3%) (a superfamília T mal definida) (12/114, 10,5%), Haarlem (8/114, 7%), clado X (6/114, 5,3%), clado S (3/114, 2,6%) e os tipos Índio da África Oriental e Manu, cada um com 1/114 (0,9%) isolados. Um número considerável de cepas (n = 20, 17,5%) mostrou padrões que não se enquadravam em nenhum dos principais clados descritos anteriormente. Concluímos que a maior parte da tuberculose (TB) (92/114, 80,7%) em nossa localização são cepas evolutivas recentes que pertencem aos principais grupos genéticos 2/3. Mais estudos sobre epidemiologia da TB são necessários para entender a biodiversidade do Mtb e a transmissão da TB nesta região.
Abstract
We performed spoligotyping on 114 strains of the Mycobacterium tuberculosis (Mtb) complex that had been isolated from patients in Minas Gerais Health Units during 2004. A total of 82/114 (72%) clinical isolates were clustered and 32/114 (28%) were unique. Seven shared types containing nine strains were newly created. A total of nine patterns corresponded to unreported orphan strains, as evaluated against all of the strains recorded in the SITVIT2 proprietary database in the Institut Pasteur de la Guadeloupe. The major clades were composed of isolates that belong to the following genotypes: Latin-America and Mediterranean (63/114, 55.3%) (the ill-defined T superfamily) (12/114, 10.5%), Haarlem (8/114, 7%), X clade (6/114, 5.3%), S clade (3/114, 2.6%) and the East-African Indian and Manu types, each with 1/114 (0.9%) isolates. A considerable number of strains (n = 20, 17.5%) showed patterns that did not fall within any of the previously described major clades. We conclude the bulk of tuberculosis (TB) (92/114, 80.7%) in our location is recent evolutionary strains that belong to the principal genetic groups 2/3. Further studies on epidemiology of TB are required to understand Mtb biodiversity and TB transmission in this region.
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