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ANALYZING SHOTGUN PROTEOMIC DATA WITH PATTERNLAB FOR PROTEOMICS
análise proteômica sem rótulo
análise proteômica baseada em rótulo
label-free proteomic analysis
label-based proteomic analysis
Autor(es)
Afiliação
Resumo
PatternLab para proteômica é um ambiente computacional completo para analisar dados proteômicos shotgun. Seus módulos fornecem meios para identificar proteínas/peptídeos que são diferencialmente expressos, aqueles que são exclusivos de um estado, e também podem agrupar aqueles que compartilham perfis de expressão semelhantes em experimentos de curso de tempo, bem como ajudar na interpretação de resultados de acordo com a Gene Ontology. O PatternLab é amigável, simples e fornece uma interface gráfica de usuário.
Resumo em Inglês
PatternLab for proteomics is a one-stop-shop computational environment for analyzing shotgun proteomic data. Its modules provide means to pinpoint proteins / peptides that are differentially expressed, those that are unique to a state, and can also cluster the ones that share similar expression profiles in time-course experiments as well as help in interpreting results according to Gene Ontology. PatternLab is user-friendly, simple, and provides a graphical user interface.
Palavras-chave
proteômica shotgunanálise proteômica sem rótulo
análise proteômica baseada em rótulo
Palavras-chave em inglês
shotgun proteomicslabel-free proteomic analysis
label-based proteomic analysis
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