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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62455
ANÁLISE DE ASSINATURAS DE MINICÍRCULOS DO KDNA DE LEISHMANIA SPP. PRESENTES EM AMOSTRAS CLÍNICAS DE PACIENTES COM LEISHMANIOSE TEGUMENTAR AMERICANA DE PERNAMBUCO
Reação em cadeia da polimerase
Técnicas de genotipagem
Leishmania
Polymerase chain reaction
Genotyping techniques
Leishmania
Reação em Cadeia da Polimerase
Técnicas de Genotipagem
Leishmania
Viana, Juliana Bezerra Medeiros | Date Issued:
2015
Advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
A Leishmaniose Tegumentar Americana (LTA) é uma doença que apresentacaracterísticas clínicas e epidemiológicas complexas, mediante a diversidade deespécies envolvidas na sua transmissão. Métodos de biologia molecular, baseadosem análise dos ácidos nucléicos, são aplicados na realização de estudos sobre avariabilidade genética dos parasitos, contudo a escolha do método e do marcador aser utilizado continua sendo um desafio. Os métodos convencionalmente utilizadospara estudos da variabilidade genética de Leishmania dependem do isolamentoprévio de parasitos em meios de cultura, o qual pode sofrer interferências de acordocom as condições de coleta e armazenamento do material biológico, além de serpassível de contaminações. Além disso, essas técnicas demandam o uso dereagentes e equipamentos adicionais que aumentam a complexidade e o custo doprocesso. Nesse contexto, a técnica molecular de LSSP-PCR (Low-StringencySingle Primer-Polimerase Chain Reaction) produz perfis genéticos que refletem asclasses de minicírculos predominantes, sendo utilizada em estudos que visamdiscriminar genótipos de espécies de Leishmania. Diante disso, o propósito doestudo foi a identificação de variantes genéticas de Leishmania presentes empacientes com diferentes manifestações clínicas da LTA. Foram incluídos no estudopacientes que apresentaram diagnósticos clínicos positivos para LTA. O diagnósticolaboratorial envolveu a abordagem molecular por meio da extração do DNA dasamostras de aspirado de lesão e sangue, seguidas da PCR convencional. 71pacientes foram analisados, havendo ocorrência de DNA do parasito em 18amostras de aspirado de lesão e nenhuma positividade através das amostras desangue. O resultado da LSSP-PCR gerou perfis de assinaturas de kDNA,mostrando, porém, que manifestações clínicas de LTA, descritas de uma maneiraabrangente, aparentemente não podem ser diferenciadas através de padrões deassinaturas de kDNA de Leishmania (Viannia) braziliensis.
Abstract
The American Cutaneous Leishmaniasis (ACL) is a disease with complex clinical andepidemiological characteristics, by the diversity of species involved in thetransmission. Molecular biology methods, based on analysis of nucleic acids, areapplied in studies of the genetic variability of parasites, but the choice of method andthe marker to be used remains a challenge. The methods conventionally used forstudies of genetic variability of Leishmania depend on prior isolation of parasites inculture media which can be influenced according to the conditions of collection andstorage of biological material, and is subject to contamination. Moreover, thesetechniques require the use of additional reagents and equipment which increase thecomplexity and cost of the process. In this context, LSSP-PCR (Low-stringencySingle Primer Polymerase Chain Reaction) molecular technique produces geneticprofiles that reflect the predominant minicircle classes being used in studies aimeddiscriminate genotypes Leishmania species. Thus, the purpose of the study was theidentification of genetic variants of Leishmania present in patients with differentclinical manifestations of LTA. The study included patients with positive clinicaldiagnosis for LTA. Laboratory diagnosis involving molecular approach by DNAextraction from samples drawn from injury and blood, followed by conventional PCR.71 patients were analyzed, with occurrence of parasite DNA in samples 18 toaspirate the lesion and no positive through blood samples. The result of LSSP-PCRgenerated kDNA signature profiles showing, however, that clinical manifestations ofACL described in a comprehensive manner, apparently cannot be differentiated bystandard kDNA signatures Leishmania (V.) braziliensis.
Keywords in Portuguese
Leishmaniose Tegumentar AmericanaReação em cadeia da polimerase
Técnicas de genotipagem
Leishmania
Keywords
American Cutaneous LeishmaniasisPolymerase chain reaction
Genotyping techniques
Leishmania
DeCS
Leishmaniose Tegumentar AmericanaReação em Cadeia da Polimerase
Técnicas de Genotipagem
Leishmania
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