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ArtigoDireito Autoral
Acesso aberto
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HI-PLEX DEEP AMPLICON SEQUENCING FOR IDENTIFICATION, HIGHRESOLUTION GENOTYPING AND MULTIDRUG RESISTANCE PREDICTION OF MYCOBACTERIUM LEPRAE DIRECTLY FROM PATIENT BIOPSIES BY USING DEEPLEX MYC-LEP
Sequenciamento de próxima geração direcionado
Resistência a antibióticos
Duplicação de domínio genético
Diagnósitco
Vigilância
Targeted next generation sequencing
Antibiotic resistance
Gene domain duplication
Diagnostics
Surveillance
Produção científica do Laboratório de Hanseníase.
Autor(es)
Jouet, Agathe
Braet, Sofie Marijke
Gaudin, Cyril
Bisch, Gaëlle
Vasconcellos, Sidra Ezidio Gonçalves
Livramento, Rebecca Emmanuela Epaminondas Nicacio de Oliveira do
Palacios, Yrneh Yadamis Prado
Fontes, Amanda Nogueira Brum
Silva, Norma Lucena Cavalcanti Licinio da
Rosa, Patrícia Sammarco
Moraes, Milton Ozório
La, Kevin
Badalato, Nelly
Lenoir, Esteban
Ferré, Alice
Clément, Marie
Hasker, Epco
Grillone, Silahi Halifa
Abdou, Wirdane
Said, Aouladi
Assoumani, Younoussa
Attoumani, Nissad
Laurent, Yannick
Cambau, Emmanuelle
Jong, Bouke Catherine de
Suffys, Philip Noël
Supply, Philip
Braet, Sofie Marijke
Gaudin, Cyril
Bisch, Gaëlle
Vasconcellos, Sidra Ezidio Gonçalves
Livramento, Rebecca Emmanuela Epaminondas Nicacio de Oliveira do
Palacios, Yrneh Yadamis Prado
Fontes, Amanda Nogueira Brum
Silva, Norma Lucena Cavalcanti Licinio da
Rosa, Patrícia Sammarco
Moraes, Milton Ozório
La, Kevin
Badalato, Nelly
Lenoir, Esteban
Ferré, Alice
Clément, Marie
Hasker, Epco
Grillone, Silahi Halifa
Abdou, Wirdane
Said, Aouladi
Assoumani, Younoussa
Attoumani, Nissad
Laurent, Yannick
Cambau, Emmanuelle
Jong, Bouke Catherine de
Suffys, Philip Noël
Supply, Philip
Afiliação
GenoScreen. Lille, France.
Institute of Tropical Medicine. Antwerp, Belgium / University of Antwerp. Department of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences. Antwerp, Belgium / Research Foundation Flanders. Brussels, Belgium.
GenoScreen. Lille, France.
GenoScreen. Lille, France.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Instituto Lauro de Souza Lima. Bauru, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hanseníase. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
APHP-GHU Paris Nord Hôpital Bichat, Service de mycobactériologie spécialisée et de référence, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux - Laboratoire Associé, Paris, France / Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
Institute of Tropical Medicine, Antwerp, Belgium.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros / National Tuberculosis and Leprosy Control Program, Moroni, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
GenoScreen, Lille, France.
Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France / Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France.
Institute of Tropical Medicine, Antwerp, Belgium.
Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Univ. Lille, CNRS, INSERM, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019 - UMR 8204 - CIIL - Center for Infection and Immunity of Lille, F-59000 Lille, France.
Institute of Tropical Medicine. Antwerp, Belgium / University of Antwerp. Department of Pharmaceutical, Biomedical and Veterinary Sciences. Antwerp, Belgium / Research Foundation Flanders. Brussels, Belgium.
GenoScreen. Lille, France.
GenoScreen. Lille, France.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Instituto Lauro de Souza Lima. Bauru, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hanseníase. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
APHP-GHU Paris Nord Hôpital Bichat, Service de mycobactériologie spécialisée et de référence, Centre National de Référence des Mycobactéries et de la Résistance des Mycobactéries aux Antituberculeux - Laboratoire Associé, Paris, France / Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
GenoScreen, Lille, France.
Institute of Tropical Medicine, Antwerp, Belgium.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
Damien Foundation, Comoros / National Tuberculosis and Leprosy Control Program, Moroni, Comoros.
Damien Foundation, Comoros.
GenoScreen, Lille, France.
Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France / Université Paris Cité, INSERM, IAME UMR1137, Paris, France.
Institute of Tropical Medicine, Antwerp, Belgium.
Fundação Oswaldo Cruz, Instituto Oswaldo Cruz, Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Univ. Lille, CNRS, INSERM, CHU Lille, Institut Pasteur de Lille, U1019 - UMR 8204 - CIIL - Center for Infection and Immunity of Lille, F-59000 Lille, France.
Resumo em Inglês
Expansion of antimicrobial resistance monitoring and epidemiological surveillance are key components
of the WHO strategy towards zero leprosy. The inability to grow Mycobacterium leprae in vitro precludes routine
phenotypic drug susceptibility testing, and only limited molecular tests are available. We evaluated a culture-free
targeted deep sequencing assay, for mycobacterial identification, genotyping based on 18 canonical SNPs and 11
core variable-number tandem-repeat (VNTR) markers, and detection of rifampicin, dapsone and fluoroquinolone
resistance-associated mutations in rpoB/ctpC/ctpI, folP1, gyrA/gyrB, respectively, and hypermutation-associated
mutations in nth.
Palavras-chave
Mycobacterium lepraeSequenciamento de próxima geração direcionado
Resistência a antibióticos
Duplicação de domínio genético
Diagnósitco
Vigilância
Palavras-chave em inglês
Mycobacterium lepraeTargeted next generation sequencing
Antibiotic resistance
Gene domain duplication
Diagnostics
Surveillance
Editor
Elsevier B.V.
Referência
JOUET, Agathe et al. Hi-plex deep amplicon sequencing for identification, highresolution genotyping and multidrug resistance prediction of Mycobacterium leprae directly from patient biopsies by using Deeplex Myc-Lep. eBioMedicine .v.93.104649, 2023.DOI
10. 1016/j.ebiom.2023. 104649ISSN
2352-3964Notas
Produção científica do Laboratório de Biologia Molecular Aplicada a Micobactérias.Produção científica do Laboratório de Hanseníase.
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