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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53828
CASE REPORT OF CURTOBACTERIUM ISOLATED FROM A CATHETER TIP SAMPLE MISIDENTIFIED AS CRONOBACTER
Autor(es)
Braga, Lygia Maria Paulo da Silva
Saad, Bruna Abdul Ahad
Oliveira, Caroline Tieppo Flores de
Volpe-Chaves, Cláudia Elizabeth
Lacerda, Mara Luci Gonçalves Galiz
Forsythe, Stephen James
Venturini, James
Oliveira, Sandra Maria do Valle Leone de
Paniago, Anamaria Mello Miranda
Costa, Luciana Veloso da
Miranda, Rebeca Vitória da Silva Lage de
Reis, Cristhiane Moura Falavina dos
Brandão, Marcelo Luiz Lima
Saad, Bruna Abdul Ahad
Oliveira, Caroline Tieppo Flores de
Volpe-Chaves, Cláudia Elizabeth
Lacerda, Mara Luci Gonçalves Galiz
Forsythe, Stephen James
Venturini, James
Oliveira, Sandra Maria do Valle Leone de
Paniago, Anamaria Mello Miranda
Costa, Luciana Veloso da
Miranda, Rebeca Vitória da Silva Lage de
Reis, Cristhiane Moura Falavina dos
Brandão, Marcelo Luiz Lima
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil / Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Foodmicrobe.com. Nottinghamshire, UK.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil / Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Regional Hospital of Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Foodmicrobe.com. Nottinghamshire, UK.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Pioneiros, MS, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumo
O gênero Curtobacterium é um membro da família Microbacteriaceae, e as espécies de Curtobacterium são reconhecidas como patógenos de plantas. O objetivo deste estudo foi investigar um resultado duvidoso de identificação de espécies para uma infecção localizada na ponta de um cateter de um paciente com Covid-19. Uma cepa isolada de uma amostra de ponta de cateter, identificada por VITEK 2 como Cronobacter spp., foi submetida à análise polifásica: Matrix-Assisted Laser Desorption IonizationTime of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) usando VITEK MS, reação em cadeia da polimerase em tempo real direcionando o gene dnaG e análise de sequenciamento Sanger do gene completo 16S rRNA para confirmação. A cepa apresentou resultado negativo por qPCR e não pôde ser identificada por MALDI-TOF MS. A análise de sequenciamento Sanger do gene completo do rRNA 16S identificou a cepa como Curtobacterium spp. A característica Gram-variável (Gram-negativa em vez de Gram-positiva) da cepa isolada foi a responsável pela identificação errônea por VITEK 2 e VITEK MS não identificou a cepa. A análise de sequenciamento completo do gene 16S rRNA identificou a cepa como gênero Curtobacterium, mas outras técnicas complementares são necessárias para identificar em nível de espécie.
Resumo em Inglês
The Curtobacterium genus is a member of the family Microbacteriaceae, and Curtobacterium species are recognized as plant pathogens. The aim of this study was to investigate a dubious result of species identification for an infection located on a catheter tip of a patient with Covid-19. A strain isolated from a catheter tip sample, identified by VITEK 2 as Cronobacter spp., was submitted to polyphasic analysis: Matrix-Assisted Laser Desorption IonizationTime of Flight Mass Spectrometry (MALDI-TOF MS) using VITEK MS, realtime polymerase chain reaction targeting dnaG gene, and 16S rRNA full gene Sanger sequencing analysis for confirmation. The strain presented negative result using qPCR and could not identified by MALDI-TOF MS. 16S rRNA full gene Sanger sequencing analysis identified the strain as Curtobacterium spp. The Gram-variable characteristic (Gram-negative instead of Gram-positive) of the isolated strain was the responsible for the misidentification by VITEK 2 and VITEK MS did not identify the strain. 16S rRNA full gene sequencing
analysis identified the strain as Curtobacterium genus, but other complementary techniques are necessary to identify at species level.
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