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ASSESSMENT OF VITEK® 2, MALDI-TOF MS AND FULL GENE 16S RRNA SEQUENCING FOR AEROBIC ENDOSPORE-FORMING BACTERIA ISOLATED FROM A PHARMACEUTICAL FACILITY
16S rRNA
Indústria Farmacêutica
Identificação bacteriana
Caracterização fenotípica
16S rRNA
Pharmaceutical industry
Bacterial identification
Phenotypic characterization
Autor
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Institudo Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisa Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Institudo Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisa Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Laboratório de Controle Microbiológico. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Institudo Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisa Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Institudo Oswaldo Cruz. Laboratório Interdisciplinar de Pesquisa Médica. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumen en portugues
O sequenciamento de VITEK®2, MALDI-TOF MS e 16S rRNA foram avaliados para a identificação de bactérias aeróbicas formadoras de endosporos (AEB) de uma instalação farmacêutica. MALDI-TOF MS demonstrou maior precisão em comparação com VITEK®2, embora ambas as bases de dados tenham sido insuficientes para identificar espécies de AEB. O sequenciamento foi a melhor metodologia, mas incapaz de identificar espécies intimamente relacionadas.
Resumen en ingles
VITEK®2, MALDI-TOF MS and 16S rRNA sequencing were evaluated for the identification of aerobic endosporeforming bacteria (AEB) from a pharmaceutical facility. MALDI-TOF MS demonstrated higher accuracy compared to VITEK®2, although both databases were insufficient to identify AEB species. Sequencing was the best methodology, but unable to identify closely related species.
Palabras clave en portugues
MALDI-TOF MS16S rRNA
Indústria Farmacêutica
Identificação bacteriana
Caracterização fenotípica
Palabras clave en ingles
MALDI-TOF MS16S rRNA
Pharmaceutical industry
Bacterial identification
Phenotypic characterization
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