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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53368
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DissertaçãoDireito Autoral
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DIVERSIDADE GENÉTICA DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLADOS DA POPULAÇÃO PRIVADA DE LIBERDADE DO MUNICÍPIO DE RECIFE, PERNAMBUCO
Prisões
Mycobacterium tuberculosisisol
Tipagem Molecularmetodos
Variação Genética
Perfil de saúde
Filogenia
Genótipo
Recidiva
Oliveira, Thaynan Sama Alves de. | Data do documento:
2019
Autor(es)
Orientador
Coorientador
Membros da banca
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Resumo
A tuberculose (TB) continua sendo um grande problema de saúde pública no Brasil, inclusive nos presídios. O objetivo deste estudo foi realizar uma investigação da epidemiologia molecular de cepas de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) da população encarcerada do Complexo Prisional Aníbal Bruno entre os anos de 2015 e 2016. Um total de 70 isolados clínicos de Mtb foram genotipados com sucesso através da técnica MIRU-VNTR. Dentre os casos avaliados todos os indivíduos eram do sexo masculino, predominantemente da raça/cor da pele parda e jovens adultos com baixa escolaridade. A forma clínica da tuberculose mais frequente era pulmonar e de casos novos, não tendo sido observados óbitos até o encerramento dos casos. A aplicação web MIRU-VNTRplus foi utilizada na construção de árvores filogenéticas e identificação das linhagens/sublinhagens associadas. A frequência de cada sublinhagem encontrada foi a seguinte: Haarlem (45,71%), LAM (12,86%), X (11,43%), Beijing (10%), mutiple matches (4,29%) e perfis desconhecidos (15,71%). Os padrões de 15 e 24 MIRU-VNTR loci foram avaliados: considerando-se 15 loci foram obtidos 47 padrões, destes 42 eram de perfis únicos e cinco correspondiam a clusters compostos por 27 isolados. A análise dos 24 loci resultou em 54 padrões, destes 51 eram de perfis únicos e três correspondiam a clusters compostos por 18 isolados. Notamos ainda a presença de sete infecções mistas entre os casos e estes isolados apresentaram um perfil alélico duplo entre dois a seis loci. Estes achados nos permitiram concluir que há uma diversidade de genótipos e sublinhagens entre as estirpes de Mtb que causam a doença na população privada de liberdade das unidades avaliadas, além de fornecer subsídios ao planejamento de medidas preventivas para a diminuição da carga de tuberculose no complexo estudado. Todavia, futuros estudos temporais da epidemiologia molecular em Recife são necessários para avaliar a dinâmica da transmissão do Mtb entre as unidades prisionais e a comunidade, além de relacionar os fatores de risco associados ao surgimento da TB (AU).
Resumo em Inglês
Tuberculosis (TB) remains a major public health problem in Brazil, including in prisons. The aim of this study was to investigate the molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) strains from the incarcerated population of the Aníbal Bruno Prison Complex between the years of 2015 and 2016. A total of 70 clinical isolates of Mtb were successfully genotyped using the MIRU-VNTR technique. Among the cases evaluated, all the individuals were male, predominantly brown skin color/race and young adults, with low educational level. The most frequent clinical form of tuberculosis were pulmonary and new cases, and no deaths were observed until the closure of the cases. The MIRU-VNTRplus web application was used for the construction of phylogenetic trees to identify the associated lineages/sublineages. The frequency of each sublineage was found as follows: Haarlem (45.71%), LAM (12.86%), X (11.43%), Beijing (10%), multiple matches (4.29%) and unknown profiles (15.71). The patterns of 15 and 24 MIRU-VNTR loci were evaluated: considering 15 loci 47 patterns were obtained, of these 42 were unique profiles and five corresponded to clusters composed of 27 isolates. Analysis of the 24 loci resulted in 54 patterns, of which 51 were single profile and three corresponded to clusters composed of 18 isolates. We also observed the presence of seven mixed infections among the cases and these isolates presented a double allelic profile between two and six loci. These findings allowed us to conclude that there is a diversity of genotypes and sublineages between the Mtb strains that cause the disease in the prisoners of the evaluated units, besides providing subsidies to the planning of preventive measures to reduce the burden of tuberculosis in the studied complex. However, future temporal studies of molecular epidemiology in Recife are necessary to evaluate the dynamics of Mtb transmission between the prison units and the community, as well as to relate the risk factors associated with the onset of TB (AU).
DeCS
Epidemiologia molecularPrisões
Mycobacterium tuberculosisisol
Tipagem Molecularmetodos
Variação Genética
Perfil de saúde
Filogenia
Genótipo
Recidiva
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