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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/53313
Type
ThesisCopyright
Open access
Sustainable Development Goals
10 Redução das desigualdadesCollections
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CARACTERIZAÇÃO MOLECULAR E AVALIAÇÃO DO IMPACTO DA VARIABILIDADE GENÉTICA NOS EPÍTOPOS DE CÉLULAS B DAS PROTEÍNAS CANDIDATAS VACINAIS DE PLASMODIUM VIVAX: PVCYRPA (P. VIVAX CYSTEINE-RICH PROTECTIVE ANTIGEN) E PVS25 (P. VIVAX OOKINETE SURFACE PROTEIN)
Amazônia Brasileira
Plasmodium vivax
PvCyRPA
Pvs25
Diversidade genética
Predição de epítopos
Proteína recombinante multiestágio
Brazilian Amazon
Plasmodium vivax
PvCyRPA
Pvs25
Genetic diversity
Epitope prediction
Multistage recombinant protein
Chaves, Lana Bittencourt | Date Issued:
2022
Author
Advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
As infecções causadas por Plasmodium vivax representam um grande problema de saúde pública, sendo esta espécie, dentre as demais do gênero Plasmodium, considerada uma das mais difíceis de se eliminar. Por esse motivo, a pesquisa de antígenos candidatos vacinais específicos para P. vivax necessita de impulso, visto que atualmente existe apenas uma única candidata vacinal em ensaios clínicos na iniciativa global de desenvolvimento de vacinas antimaláricas. Torna-se assim fundamental a pesquisa de novos candidatos vacinais. Nesse contexto, as proteínas PvCelTOS, PvCyRPA e Pvs25 vêm sendo consideradas novas alternativas na busca de candidatos vacinais contra a malária. Embora expressas em estágios diferentes, individualmente, desempenham importantes funções durante as fases pré-eritrocítica, eritrocítica e sexuada do ciclo biológico do P. vivax. Entretanto, dada a complexidade do ciclo biológico do Plasmodium, acreditamos que uma composição antigênica ideal deveria ser direcionada a múltiplos estágios de desenvolvimento do parasito. Nesse sentido, nos propomos a identificar estas sequências de PvCelTOS (dados anteriormente publicados no final do mestrado), PvCyRPA (presente estudo – Artigo 1) e Pvs25 (presente estudo – Artigo 2) em isolados brasileiros, mapear as regiões imunogênicas conservadas e avaliar a resposta imune naturalmente adquirida de indivíduos expostos ao P. vivax, para a construção de um antígeno quimérico potencialmente vacinal contra os três estágios de desenvolvimento do parasito no hospedeiro vertebrado (esporozoítos, merozoítos e oocinetos). Destarte, identificamos e caracterizamos os genes pvcyrpa e pvs25 em 98 isolados da Amazônia Brasileira, e seus impactos na antigenicidade dos epítopos de células B. Parâmetros de diversidade genética, análise genética populacional, teste de neutralidade e rede de junção de medianas foram analisados, bem como o impacto dos polimorfismos de aminoácidos nos epítopos de células B, utilizando as ferramentas de sequenciamento genético e predição de epítopos. O gene pvcyrpa apresenta uma variação moderada, o que poderia influenciar os potenciais epítopos de células B e, consequentemente, o reconhecimento de anticorpos. Apesar das alterações de aminoácidos observadas na população e sequências estudadas em todo o mundo, os potenciais alvos de anticorpos não parecem ser significativamente afetados. Em relação ao gene pvs25, nossos dados sugerem que é um gene conservado entre os isolados brasileiros. Nossos dados apresentam uma observação importante, considerando a potencialidade desses antígenos como uma vacina candidata para cobrir distintas áreas endêmicas de P. vivax em todo o mundo
Abstract
Infections caused by Plasmodium vivax represent a major public health problem, and this species is considered one of the most difficult to eliminate among Plasmodium spp. For this reason, the search for specific vaccine candidate antigens for P. vivax needs a boost, as there is currently only a single vaccine candidate in clinical trials in the global anti-malarial vaccine development initiative. Thus, the search for new vaccine candidates becomes essential. In this context, the proteins PvCelTOS, PvCyRPA and Pvs25 have been considered new alternatives in the search for vaccine candidates against malaria. Although expressed at different stages, individually, they play important roles during the pre-erythrocytic, erythrocytic and sexual phases of the P. vivax life cycle. However, given the complexity of the Plasmodium life cycle, we believe that an ideal antigenic composition should target multiple stages of parasite development. In this sense, we propose to identify these sequences of PvCelTOS (data previously published at the end of the master's), PvCyRPA (present study - Article 1) and Pvs25 (present study - Article 2) in Brazilian isolates, map the conserved immunogenic regions and evaluate the naturally acquired immune response of individuals exposed to P. vivax, for the construction of a chimeric antigen potentially vaccinating against the three stages of development of the parasite in the vertebrate host (sporozoites, merozoites and ookinetes). Thus, we identified and characterized the pvcyrpa and pvs25 genes in 98 isolates from the Brazilian Amazon, and their impacts on the antigenicity of B cell epitopes. Parameters of genetic diversity, population genetic analysis, neutrality test and median junction network were analyzed, as well as the impact of amino acid polymorphisms on B cell epitopes, using genetic sequencing and epitope prediction tools. The pvcyrpa gene shows moderate variation, which could influence potential B cell epitopes and, consequently, antibody recognition. Despite the observed amino acid changes in the population and sequences studied worldwide, potential antibody targets do not appear to be significantly affected. Regarding the pvs25 gene, our data suggest that it is a conserved gene among Brazilian isolates. Our data present an important observation, considering the potential of these antigens as a candidate vaccine to cover different endemic areas of P. vivax worldwide
Keywords in Portuguese
MaláriaAmazônia Brasileira
Plasmodium vivax
PvCyRPA
Pvs25
Diversidade genética
Predição de epítopos
Proteína recombinante multiestágio
Keywords
MalariaBrazilian Amazon
Plasmodium vivax
PvCyRPA
Pvs25
Genetic diversity
Epitope prediction
Multistage recombinant protein
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