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03 Saúde e Bem-EstarColeções
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GENOMIC EPIDEMIOLOGY REVEALS THE IMPACT OF NATIONAL AND INTERNATIONAL RESTRICTIONS MEASURES ON THE SARS-COV-2 EPIDEMIC IN BRAZIL
Pandemia por COVID-19
Epidemiologia Molecular
Genômica
Vigilância em Saúde Pública
América Latina
Autor(es)
Giovanetti, Marta
Slavov, Svetoslav Nanev
Fonseca, Vagner
Wilkinson, Eduan
Tegally, Houriiyah
Patané, José Salvatore Leister
Viala, Vincent Louis
San, James Emmanuel
Rodrigues, Evandra Strazza
Santos, Elaine Vieira
Aburjaile, Flavia
Xavier, Joilson
Fritsch, Hegger
Adelino, Talita Emile Ribeiro
Pereira, Felicidade
Leal, Arabela
Iani, Felipe Campos de Melo
Pereira, Glauco de Carvalho
Vazquez, Cynthia
Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia
Oliveira, Elaine Cristina de
Demarchi, Luiz
Croda, Julio
Bezerra, Rafael dos Santos
Lima, Loyze Paola Oliveira de
Martins, Antonio Jorge
Barros, Claudia Renata dos Santos
Marqueze, Elaine Cristina
Bernardino, Jardelina de Souza Todao
Moretti, Debora Botequio
Brassaloti, Ricardo Augusto
Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos
Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa
Kitajima, João Paulo
Santos, Bibiana
Proto-Siqueira, Rodrigo
Cantarelli, Vlademir Vicente
Tosta, Stephane
Nardy, Vanessa Brandão
Silva, Luciana Reboredo de Oliveira da
Gómez, Marcela Kelly Astete
Lima, Jaqueline Gomes
Ribeiro, Adriana Aparecida
Guimarães, Natália Rocha
Watanabe, Luiz Takao
Silva, Luana Barbosa da
Ferreira, Raquel da Silva
Penha, Mara Patricia F. da
Ortega, María José
Fuente, Andrea Gómez de la
Villalba, Shirley
Torales, Juan
Gamarra, María Liz
Aquino, Carolina
Figueredo, Gloria Patricia Martínez
Fava, Wellington Santos
Motta-Castro, Ana Rita C.
Venturini, James
Oliveira, Sandra Maria do Vale Leone de
Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone
Rossa, Maria do Carmo Debur
Becker, Guilherme Nardi
Presibella, Mayra Marinho
Marques, Nelson Quallio
Riediger, Irina Nastassja
Raboni, Sonia
Coelho, Gabriela Mattoso
Cataneo, Allan Henrique Depieri
Zanluca, Camila
Santos, Claudia Nunes Duarte dos
Assato, Patricia Akemi
Costa, Felipe Allan da Silva da
Poleti, Mirele Daiana
Lesbon, Jessika Cristina Chagas
Mattos, Elisangela Chicaroni
Banho, Cecilia Artico
Sacchetto, Lívia
Moraes, Marília Mazzi
Grotto, Rejane Maria Tommasini
Souza-Neto, Jayme A.
Nogueira, Maurício Lacerda
Fukumasu, Heidge
Coutinho, Luiz Lehmann
Calado, Rodrigo Tocantins
Neto, Raul Machado
Filippis, Ana Maria Bispo de
Cunha, Rivaldo Venancio da
Freitas, Carla
Peterka, Cassio Roberto Leonel
Fernandes, Cássia de Fátima Rangel
Araújo, Wildo Navegantes de
Said, Rodrigo Fabiano do Carmo
Almiron, Maria
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Lourenço, José
Oliveira, Tulio de
Holmes, Edward C.
Haddad, Ricardo
Sampaio, Sandra Coccuzzo
Elias, Maria Carolina
Kashima, Simone
Alcantara, Luiz Carlos Junior de
Covas, Dimas Tadeu
Slavov, Svetoslav Nanev
Fonseca, Vagner
Wilkinson, Eduan
Tegally, Houriiyah
Patané, José Salvatore Leister
Viala, Vincent Louis
San, James Emmanuel
Rodrigues, Evandra Strazza
Santos, Elaine Vieira
Aburjaile, Flavia
Xavier, Joilson
Fritsch, Hegger
Adelino, Talita Emile Ribeiro
Pereira, Felicidade
Leal, Arabela
Iani, Felipe Campos de Melo
Pereira, Glauco de Carvalho
Vazquez, Cynthia
Sanabria, Gladys Mercedes Estigarribia
Oliveira, Elaine Cristina de
Demarchi, Luiz
Croda, Julio
Bezerra, Rafael dos Santos
Lima, Loyze Paola Oliveira de
Martins, Antonio Jorge
Barros, Claudia Renata dos Santos
Marqueze, Elaine Cristina
Bernardino, Jardelina de Souza Todao
Moretti, Debora Botequio
Brassaloti, Ricardo Augusto
Cassano, Raquel de Lello Rocha Campos
Mariani, Pilar Drummond Sampaio Corrêa
Kitajima, João Paulo
Santos, Bibiana
Proto-Siqueira, Rodrigo
Cantarelli, Vlademir Vicente
Tosta, Stephane
Nardy, Vanessa Brandão
Silva, Luciana Reboredo de Oliveira da
Gómez, Marcela Kelly Astete
Lima, Jaqueline Gomes
Ribeiro, Adriana Aparecida
Guimarães, Natália Rocha
Watanabe, Luiz Takao
Silva, Luana Barbosa da
Ferreira, Raquel da Silva
Penha, Mara Patricia F. da
Ortega, María José
Fuente, Andrea Gómez de la
Villalba, Shirley
Torales, Juan
Gamarra, María Liz
Aquino, Carolina
Figueredo, Gloria Patricia Martínez
Fava, Wellington Santos
Motta-Castro, Ana Rita C.
Venturini, James
Oliveira, Sandra Maria do Vale Leone de
Gonçalves, Crhistinne Cavalheiro Maymone
Rossa, Maria do Carmo Debur
Becker, Guilherme Nardi
Presibella, Mayra Marinho
Marques, Nelson Quallio
Riediger, Irina Nastassja
Raboni, Sonia
Coelho, Gabriela Mattoso
Cataneo, Allan Henrique Depieri
Zanluca, Camila
Santos, Claudia Nunes Duarte dos
Assato, Patricia Akemi
Costa, Felipe Allan da Silva da
Poleti, Mirele Daiana
Lesbon, Jessika Cristina Chagas
Mattos, Elisangela Chicaroni
Banho, Cecilia Artico
Sacchetto, Lívia
Moraes, Marília Mazzi
Grotto, Rejane Maria Tommasini
Souza-Neto, Jayme A.
Nogueira, Maurício Lacerda
Fukumasu, Heidge
Coutinho, Luiz Lehmann
Calado, Rodrigo Tocantins
Neto, Raul Machado
Filippis, Ana Maria Bispo de
Cunha, Rivaldo Venancio da
Freitas, Carla
Peterka, Cassio Roberto Leonel
Fernandes, Cássia de Fátima Rangel
Araújo, Wildo Navegantes de
Said, Rodrigo Fabiano do Carmo
Almiron, Maria
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Lourenço, José
Oliveira, Tulio de
Holmes, Edward C.
Haddad, Ricardo
Sampaio, Sandra Coccuzzo
Elias, Maria Carolina
Kashima, Simone
Alcantara, Luiz Carlos Junior de
Covas, Dimas Tadeu
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Universidad Nacional del Caaguazú. Instituto Regional de Investigación en Salud. Coronel Oviedo, Paraguay. / Laboratorio de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Coronel Oviedo, Paraguay. / Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Coronel Oviedo, Paraguay.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
NGS Soluções Genômicas. Piracicaba, SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica. São Paulo, SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Vigilância em Saúde do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Universidad Nacional del Caaguazú. Instituto Regional de Investigación en Salud. Coronel Oviedo, Paraguay. / Laboratorio de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Coronel Oviedo, Paraguay. / Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Coronel Oviedo, Paraguay.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Mato Grosso do Sul. MS, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Universidade Federal do Paraná. Hospital das Clínicas. Curitiba, PR, Brasil.
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil. / Universidade Estadual de São Paulo. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. Laboratório de Biologia Molecular. Botucatu, SP, Brasil.
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Biomanguinhos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Departamento de Imunização e Doenças Transmissíveis. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Department of Zoology. Peter Medawar Building. University of Oxford. Oxford, UK. / Universidade de Lisboa. Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas. Lisboa, PT, Portugal.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa. / Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa (CAPRISA). Durban, South Africa. / Department of Global Health. University of Washington. Seattle, WA, USA.
Sydney Institute for Infectious Diseases. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. University of Sydney. Sydney, NSW, Australia.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Universidad Nacional del Caaguazú. Instituto Regional de Investigación en Salud. Coronel Oviedo, Paraguay. / Laboratorio de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Coronel Oviedo, Paraguay. / Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Coronel Oviedo, Paraguay.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
NGS Soluções Genômicas. Piracicaba, SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica. São Paulo, SP, Brasil.
Mendelics Análise Genômica. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre. Porto Alegre, RS, Brasil.
Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Vigilância em Saúde do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Laboratorio Central de Salud Pública. Asunción, Paraguay.
Universidad Nacional del Caaguazú. Instituto Regional de Investigación en Salud. Coronel Oviedo, Paraguay. / Laboratorio de Biología Molecular. Hospital Regional de Coronel Oviedo. Coronel Oviedo, Paraguay. / Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social. Coronel Oviedo, Paraguay.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Mato Grosso do Sul. MS, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Laboratório Central do Estado do Paraná. São José dos Pinhais, PR, Brasil.
Universidade Federal do Paraná. Hospital das Clínicas. Curitiba, PR, Brasil.
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Universidade Estadual de São Paulo. Faculdade de Ciências Agrárias. Departamento de Bioprocessos e Biotecnologia. Botucatu, SP, Brasil. / Universidade Estadual de São Paulo. Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu. Laboratório de Biologia Molecular. Botucatu, SP, Brasil.
Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto. Departamento de Doenças Dermatológicas, Infecciosas e Parasitárias. Laboratório de Pesquisas em Virologia. São José do Rio Preto, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Zootecnia e Engenharia de Alimentos. Pirassununga, São Paulo, Brasil.
Universidade de São Paulo. Centro de Genômica Funcional da ESALQ. Piracicaba, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Biomanguinhos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Departamento de Imunização e Doenças Transmissíveis. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. / Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Department of Zoology. Peter Medawar Building. University of Oxford. Oxford, UK. / Universidade de Lisboa. Instituto de Biossistemas e Ciências Integrativas. Lisboa, PT, Portugal.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP). School of Laboratory Medicine and Medical Sciences. College of Health Sciences. University of KwaZulu-Natal. Durban, South Africa. / Centre for Epidemic Response and Innovation (CERI). School of Data Science and Computational Thinking. Stellenbosch University. Stellenbosch, South Africa. / Centre for the AIDS Programme of Research in South Africa (CAPRISA). Durban, South Africa. / Department of Global Health. University of Washington. Seattle, WA, USA.
Sydney Institute for Infectious Diseases. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. University of Sydney. Sydney, NSW, Australia.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Universidade de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto. Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. São Paulo, SP, Brasil.
Resumo em Inglês
from May 2021 made Latin America a pandemic epicenter. Although SARS-CoV-2 established sustained transmission in Brazil early in the pandemic, important gaps remain in our understanding of virus transmission dynamics at the national scale. Here, we describe the genomic epidemiology of SARS-CoV-2 using near-full genomes sampled from 27 Brazilian states and a bordering country - Paraguay. We show that the early stage of the pandemic in Brazil was characterised by the co-circulation of multiple viral lineages, linked to multiple importations predominantly from Europe, and subsequently characterized by large local transmission clusters. As the epidemic progressed under an absence of effective restriction measures, there was a local emergence and onward international spread of Variants of Concern (VOC) and Variants Under Monitoring (VUM), including Gamma (P.1) and Zeta (P.2). In addition, we provide a preliminary genomic overview of the epidemic in Paraguay, showing evidence of importation from Brazil. These data reinforce the usefulness and need for the implementation of widespread genomic surveillance in South America as a toolkit for pandemic monitoring that provides a means to follow the real-time spread of emerging SARS-CoV-2 variants with possible implications for public health and immunization strategies.
Palavras-chave
SARS-CoV-2Pandemia por COVID-19
Epidemiologia Molecular
Genômica
Vigilância em Saúde Pública
América Latina
Editor
medRxiv
Referência
GIOVANETTI, Marta et al. Genomic epidemiology reveals the impact of national and international restrictions measures on the SARS-CoV-2 epidemic in Brazil. medRxiv, p. 1–39, 2022.Itens relacionados
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