Por favor, use este identificador para citar o enlazar este ítem:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/52524
Tipo
DisertaciónDerechos de autor
Acceso abierto
Colecciones
Metadatos
Mostrar el registro completo del ítem
RESISTÊNCIA ÀS POLIMIXINAS EM ESPÉCIES DO COMPLEXO ENTEROBACTER CLOACAE E KLEBSIELLA AEROGENES NO BRASIL: CARACTERIZAÇÃO FENOTÍPICA E MOLECULAR
Complexo Enterobacter cloacae
Klebsiella aerogenes
Carbapenemases
Costa, Bianca Santos da | Fecha del documento:
2021
Autor
Miembros de la junta
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumen en portugues
A produção de carbapenemases por enterobactérias é um problema de saúde pública global, uma vez que reduz as opções terapêuticas para tratamento das infecções causadas por essas bactérias, sendo necessário utilizar compostos de polimixinas como uma das últimas opçôes disponíveis. Nós investigamos a frequência e os mecanismos relacionados à resistência às polimixinas em amostras do complexo Enterobacter cloacae e Klebsiella aerogenes encaminhadas ao Laboratório de Pesquisa em Infecção Hospitalar (LAPIH/FIOCRUZ) no período de 2016 a 2018. A seleção das amostras foi realizada com a semeadura de 124 amostras (94 do complexo E. cloacae e 30 K. aerogenes) em meio de cultura EMB acrescido de 4 µg/mL de sulfato de colistina e submetidas posteriormente ao teste de microdiluição em caldo para a determinação da concentração mínima inibitória. O perfil de susceptibilidade a 17 antimicrobianos foi realizado através do teste disco difusão em ágar. Foi realizado PCR para detecção dos genes codificadores de carbapenemases (blaKPC, blaNDM e blaOXA-48) e genes plasmidiasis de resistência às polimixinas mcr (variantes alélicas 1-9). Foi realizado o sequenciamento do gene hsp60 para identificação das espécies do complexo E. cloacae e a determinação da diversidade genética foi realizada por PFGE e MLST. Das 124 amostras, 23 (19%) foram consideradas resistentes à colistina (19/94 complexo E. cloacae e 4/30 K. aerogenes) após a microdiluição em caldo com CIM variando de 4 a 128 µg/mL. E. hormaechei subsp. steigerwaltii foi a espécie mais frequente no complexo, seguido de E. cloacae subsp. cloacae Os antimicrobianos com menor taxa de resistência foram gentamicina (22%), amicacina (22%) e tigeciclina (22%). Pelo teste fenotípico BlueCarba foram detectadas 8 amostras produtoras de carbapenemases (serinobetalactamase=6 e metalobetalactamase=2). Através da PCR, essas carbapenemases foram identificadas como blaKPC n=6 e blaNDM n=2. Apenas em uma amostra foi detectado o gene mcr-9. Dentre as modificações encontradas em PmrA, PmrB, PhoP e PhoQ (proteínas do sistema de dois componentes), foi encontrada a substituição S175I em foi considerada deletéria entre as amostras de E. cloacae subsp cloacae. Foram identificados 13 perfis por PFGE no complexo E. cloacae, sendo o EcD (E. cloacae subsp cloacae) o mais frequente. Em K. aerogenes, 4 perfis foram identificados. Por MLST, 11 ST’s foram identificados (1 novo) em E. cloacae e 2 em K. aerogenes, sendo 1 novo. A taxa de resistência à polimixina, associada à resistência à maioria dos antimicrobianos testados e à presença de carbapenemases alerta para necessidade de mais estudos com objetivo de elucidar os mecanismos envolvidos com a resistência a polimixina no complexo E. cloacae e K. aerogenes e desenvolvimento de medidas para controle e prevenção de infecções causadas por bactérias multirresistentes
Resumen en ingles
The carbapenemases production by Enterobacteriaceae is a global public health problem, since it reduces the therapeutic options for treating infections caused for these bacteria, been necessary to use polymyxin compounds as one of the option available. Here we investigated the colistin resistance rate and mechanisms related to resistance among Enterobacter cloacae complex and Klebsiella aerogenes isolates. The isolates selection was carried out by screening 124 isolates (94 E. cloacae complex and 30 K. aerogenes) in EMB agar containing 4µg/mL of colistin sulfate followed by broth microdilution test for determining the Minimum Inhibitory Concentration (MIC). The susceptibility to 17 antimicrobials was performed by disk diffusion test. PCR was performed to detect carbapenemases encoding genes (blaKPC, blaNDM and blaOXA48) and plasmidial genes for resistance to polymyxins (mcr1-9). The hsp60 gene was sequenced to identify species of the E. cloacae complex. Genetic diversity was evaluated by PFGE and MLST. Among 124 isolates evaluated, 23 (19%) were colistin resistant. While 19 of 94 (20%) E. cloacae complex isolates were colistin-resistant, only 4 of 30 (13%) K. aerogenes isolates showed resistance with MIC ranging from 4 to 128µg / mL. E. hormaechei subsp. steigerwaltii was the prevalent species in the complex, followed by E. cloacae subsp. cloacae The antimicrobials with the highest susceptibility rate were gentamicin (22%), amikacin (22%) and tigecycline (22%). By Blue Carba were detected 8 isolates positive for carbapenemases. Carbapenemases encoding genes (blaKPC n = 6, blaNDM n = 2) were detected in 8 isolates and mcr-9 in one. Among the modifications found in PmrA, PmrB, PhoP e PhoQ (two-component regulatory system), only the S175I substitution in PmrB found in E. cloacae subsp cloacae isolates was considered deleterious. By PFGE, 13 profiles were found among E. cloacae complex isolates, with EcD the most frequent. In K. aerogenes, 4 profiles were identified. By MLST, 11 ST’s were identified (1 new ST) in E. cloacae and 2 in K. aerogenes (1 new ST). The polymyxin-resistance rate, associated with resistance to most of antimicrobials tested and the presence of carbapenemases, warns of need to elucidate the mechanisms involved in the resistance to polymyxin in the E. cloacae complex and K. aerogene for development measures to control and prevent infections caused by these multiresistant bacteria
Palabras clave en portugues
Resistência à polimixinaComplexo Enterobacter cloacae
Klebsiella aerogenes
Carbapenemases
Compartir