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- IOC - Artigos de Periódicos [12642]
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RECURRENT DISSEMINATION OF SARS-COV-2 THROUGH THE URUGUAYAN–BRAZILIAN BORDER
Epidemiologia
Filogeografia
Filogenética
SARS-CoV-2
Uruguai
Brasil
Rede Genômica Fiocruz
GENOMAHCOV
Author
Mir, Daiana
Rego, Natalia
Resende, Paola Cristina
Tort, Fernando
Fernández-Calero, Tamara
Noya, Verónica
Brandes, Mariana
Possi, Tania
Arleo, Mailen
Reyes, Natalia
Victoria, Matias
Lizasoain, Andres
Castells, Matías
Maya, Leticia
Salvo, Matías
Gregagianini, Tatiana Schäffer
Rosa, Marilda Tereza Mar da
Martins, Letícia Garay
Alonso, Cecilia
Vega, Yasser
Salazar, Cecilia
Ferrés, Ignacio
Smircich, Pablo
Silveira, Jose Sotelo
Fort, Rafael Sebastián
Mathó, Cecilia
Arantes, Ighor
Appolinario, Luciana
Mendonça, Ana Carolina
Benitez-Galeano, Maria José
Simões, Camila
Graña, Martin
Motta, Fernando
Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de
Bello, Gonzalo
Colina, Rodney
Spangenberg, Lucia
Rego, Natalia
Resende, Paola Cristina
Tort, Fernando
Fernández-Calero, Tamara
Noya, Verónica
Brandes, Mariana
Possi, Tania
Arleo, Mailen
Reyes, Natalia
Victoria, Matias
Lizasoain, Andres
Castells, Matías
Maya, Leticia
Salvo, Matías
Gregagianini, Tatiana Schäffer
Rosa, Marilda Tereza Mar da
Martins, Letícia Garay
Alonso, Cecilia
Vega, Yasser
Salazar, Cecilia
Ferrés, Ignacio
Smircich, Pablo
Silveira, Jose Sotelo
Fort, Rafael Sebastián
Mathó, Cecilia
Arantes, Ighor
Appolinario, Luciana
Mendonça, Ana Carolina
Benitez-Galeano, Maria José
Simões, Camila
Graña, Martin
Motta, Fernando
Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de
Bello, Gonzalo
Colina, Rodney
Spangenberg, Lucia
Affilliation
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Bioinformaítica. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Bioinformática. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Departamento de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad Católica del Uruguay. Montevideo, Uruguay.
Unidad de Bioinformatíca. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Unidad de Bioinformática. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
CENUR Este-Sede Rocha-Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio DILAVE/MGAP-INIA-Universidad de la República. Tacuarembó, Uruguay.
Institut Pasteur de Montevideo. Laboratorio de Genómica Microbiana. Montevideo, Uruguay.
Institut Pasteur de Montevideo. Laboratorio de Genómica Microbiana. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Laboratorio de Interacciones Moleculares. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Sección Biología Celular. Departamento de Biología Celular y Molecular. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Laboratorio de Interacciones Moleculares. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Sección Biología Celular. Departamento de Biología Celular y Molecular. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratorio de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratorio de AIDS e Imunologia Molecular;Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Bioinformaítica. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Departamento de Informática y Ciencias de la Computación. Universidad Católica del Uruguay. Montevideo, Uruguay.
Unidad de Bioinformaítica. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Bioinformática. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Departamento de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad Católica del Uruguay. Montevideo, Uruguay.
Unidad de Bioinformatíca. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Unidad de Bioinformática. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Biología Molecular. Sanatorio Americano. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Sul. Centro Estadual de Vigilância em Saúde. Laboratório Central de Saúde Pública. Porto Alegre, RS, Brasil.
CENUR Este-Sede Rocha-Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Laboratorio DILAVE/MGAP-INIA-Universidad de la República. Tacuarembó, Uruguay.
Institut Pasteur de Montevideo. Laboratorio de Genómica Microbiana. Montevideo, Uruguay.
Institut Pasteur de Montevideo. Laboratorio de Genómica Microbiana. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Laboratorio de Interacciones Moleculares. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Sección Biología Celular. Departamento de Biología Celular y Molecular. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Laboratorio de Interacciones Moleculares. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Departamento de Genómica. Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable. MEC Sección Biología Celular. Departamento de Biología Celular y Molecular. Facultad de Ciencias. Universidad de la República. Montevideo, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratorio de AIDS e Imunologia Molecular. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Genómica y Bioinformática. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Respiratórios e Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratorio de AIDS e Imunologia Molecular;Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratorio de Virología Molecular. Departamento de Ciencias Biológicas. Centro Universitario Regional Litoral Norte. Universidad de la República. Salto, Uruguay.
Unidad de Bioinformaítica. Institut Pasteur de Montevideo. Montevideo, Uruguay / Departamento de Informática y Ciencias de la Computación. Universidad Católica del Uruguay. Montevideo, Uruguay.
Abstract
Uruguay is one of the few countries in the Americas that successfully contained the coronavirus disease 19 (COVID-19) epidemic during the first half of 2020. Nevertheless, the intensive human mobility across the dry border with Brazil is a major challenge for public health authorities. We aimed to investigate the origin of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) strains detected in Uruguayan localities bordering Brazil as well as to measure the viral flux across this ∼1,100 km uninterrupted dry frontier. Using complete SARS-CoV-2 genomes from the Uruguayan–Brazilian bordering region and phylogeographic analyses, we inferred the virus dissemination frequency between Brazil and Uruguay and characterized local outbreak dynamics during the first months (May–July) of the pandemic. Phylogenetic analyses revealed multiple introductions of SARS-CoV-2 Brazilian lineages B.1.1.28 and B.1.1.33 into Uruguayan localities at the bordering region. The most probable sources of viral strains introduced to Uruguay were the Southeast Brazilian region and the state of Rio Grande do Sul. Some of the viral strains introduced in Uruguayan border localities between early May and mid-July were able to locally spread and originated the first outbreaks detected outside the metropolitan region. The viral lineages responsible for Uruguayan urban outbreaks were defined by a set of between four and 11 mutations (synonymous and non-synonymous) with respect to the ancestral B.1.1.28 and B.1.1.33 viruses that arose in Brazil, supporting the notion of a rapid genetic differentiation between SARS-CoV-2 subpopulations spreading in South America. Although Uruguayan borders have remained essentially closed to non-Uruguayan citizens, the inevitable flow of people across the dry border with Brazil allowed the repeated entry of the virus into Uruguay and the subsequent emergence of local outbreaks in Uruguayan border localities. Implementation of coordinated bi-national surveillance systems is crucial to achieve an efficient control of the SARS-CoV-2 spread across this kind of highly permeable borderland regions around the world.
Keywords in Portuguese
GenômicaEpidemiologia
Filogeografia
Filogenética
SARS-CoV-2
Uruguai
Brasil
Rede Genômica Fiocruz
GENOMAHCOV
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