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Artículo
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CHIKUNGUNYA VIRUS ECSA LINEAGE REINTRODUCTION IN THE NORTHEASTERNMOST REGION OF BRAZIL
Xavier, Joilson et al. | Fecha del documento: 2021
Autor
Xavier, Joilson
Fonseca, Vagner
Bezerra, João Felipe
Alves, Manoella do Monte
Mares-Guia, Maria Angélica
Claro, Ingra Morales
Jesus, Ronaldo de
Adelino, Talita Émile Ribeiro
Araújo, Emerson
Cavalcante, Karina Ribeiro Leite Jardim
Tosta, Stephane
Souza, Themis Rocha de
Cruz, Flavia Emanuelle Moreira da
Fabri, Allison de Araújo
Oliveira, Elaine Cristina
Moura, Noely Fabiana Oliveira de
Said, Rodrigo Fabiano do Carmo
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Azevedo, Vasco
Oliveira, Tulio de
Filippis, Ana Maria Bispo de
Cunha, Rivaldo Venâncio da
Luz, Kleber Giovanni
Giovanetti, Marta
Alcantara, Luiz Carlos Junior
Afiliación
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), University of KwaZuluNatal, Durban, South Africa.
Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte Dr. Almino Fernandes. Natal, RN, Brasil / Universidade Federal da Paraíba. Escola Técnica de Saúde. PB, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Departamento de Infectologia. Natal, RN, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical.São Paulo, SP, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Norte. RN, Brasil.
Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Norte. RN, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), University of KwaZuluNatal, Durban, South Africa.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz Pantanal, Campo Grande, MS, Brasil.
Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Departamento de Infectologia. Natal, RN, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumen en ingles
The Northeast region of Brazil registered the second-highest incidence proportion of Chikungunya fever in 2019. In that year, an outbreak consisting of patients presenting with febrile disease associated with joint pain was reported by the public primary health care service in the city of Natal, in the state of Rio Grande do Norte, in March 2019. At first, the aetiological agent of the disease was undetermined. Since much is still unknown about chikungunya virus' (CHIKV) genomic diversity and evolutionary history in this northeasternmost state, we used a combination of portable whole-genome sequencing, molecular clock, and epidemiological analyses that revealed the reintroduction of the CHIKV East-Central-South African (ECSA) lineage into Rio Grande do Norte. We estimated that the CHIKV ECSA lineage was first introduced into Rio Grande do Norte in early June 2014, while the 2019 outbreak clade diverged around April 2018, during a period of increased Chikungunya incidence in the Southeast region, which might have acted as a source of virus dispersion towards the Northeast region. Together, these results confirm that the ECSA lineage continues to spread across the country through interregional importation events, likely mediated by human mobility.
Palabras clave en portugues
Vírus chikungunya
Linhagem ECSA
Nordeste do Brasil
Epidemiologia genômica
 
Palabras clave en ingles
Chikungunya virus
ECSA lineage
Northeast Brazil
Genomic epidemiology
 
Editor
Elsevier
Referencia
XAVIER, Joilson et al. Chikungunya virus ECSA lineage reintroduction in the northeasternmost region of Brazil. International Journal of Infectious Diseases, v. 105, p. 120-123, 2021.
DOI
10.1016/j.ijid.2021.01.26
ISSN
1201-9712