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IDENTIFICATION OF SARS-COV-2 AND ADDITIONAL RESPIRATORY PATHOGENS CASES UNDER THE INVESTIGATION OF COVID-19 INITIAL PHASE IN A BRAZILIAN REFERENCE LABORATORY
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Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação-Geral de Laboratórios. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação-Geral de Laboratórios. Brasília, DF, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação-Geral de Laboratórios. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação-Geral de Laboratórios. Brasília, DF, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios e do Sarampo. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract
Coronavirus disease 2019 (COVID-19) surveillance, in Brazil, initiated shortly after its description, in China. Our aim was to detect severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and additional pathogens in samples from the initial phase of the outbreak in Brazil, from late February to late March. From 707 samples analysed, 29 (4.1%) were SARS-CoV-2 positive. Fever and cough were their most prevalent symptoms. Co-detection of rhinovirus was observed in 2 (6.9%) cases. Additional pathogens were identified in 66.1% of the SARS-CoV-2 negative cases, mainly rhinovirus and influenza A(H1N1) pdm09. Thus, we emphasise the importance of differential diagnosis in COVID-19 suspected cases.
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