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Tipo de documento
ArtigoDireito Autoral
Acesso restrito
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2021-04-02
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ADJACENT DIMER EPITOPE OF ENVELOPE PROTEIN AS AN IMPORTANT REGION FOR ZIKA VIRUS SERUM NEUTRALIZATION: A COMPUTATIONAL INVESTIGATION
Conservation Analysis
Epitope Mapping
Molecular Dynamics Simulation
Neutralizing Antibodies
Autor(es)
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Fundação Oswaldo Cruz. Plataforma de Pesquisa em Medicina Translacional. São Paulo, SP. Brasil / Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina de Ribeirão. Preto Departamento de Bioquímica e Imunologia. Ribeirão Preto, SP, Brazil.
Resumo em Inglês
The recent emergence of Zika virus (ZIKV) has affected many countries, with severe clinical manifestations such as fetal microcephaly and Guillain-Barré syndrome. However, even though it is a major public health concern, there is no approved treatment available. Structural knowledge of the main neutralization regions of the envelope (E) protein of ZIKV and its interactions with neutralizing antibodies (nAbs) are crucial for the rational development of subunit vaccines and establishment of antibody-based interventions. In this study we screened from public data hot spot epitopes in conserved regions of ZIKV E protein that are nAbs targets. The result points to a conserved epitope located at domain II of the ZIKV E protein, namely adjacent dimer epitope, which is the ZIKV-117 and Z20 nAbs target. Although these two nAbs have been isolated from different donors, we have demonstrated, from structural and energetic details obtained by molecular dynamics of native and mutants, that hot spots residues of the epitope are the same for these nAbs, thereby indicating that they may share similar binding and neutralization mechanism. This convergence of information between these nAbs is important because both are potential targets for the development of therapies against ZIKV and only Z20 has its sequence and its complex structure with ZIKV E protein determined. Finally, these findings also contribute to existing knowledge, by fine mapping of the epitope/paratope residue pairs that are important for biotechnological development of therapies such as epitope mimetics for subunit vaccines and the rational design for antibody-based interventions against ZIKV.Communicated by Ramaswamy H. Sarma.
Palavras-chave em inglês
Zika Virus NeutralizationConservation Analysis
Epitope Mapping
Molecular Dynamics Simulation
Neutralizing Antibodies
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