Please use this identifier to cite or link to this item:
https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/36125
Type
DissertationCopyright
Open access
Embargo date
2020-04-03
Collections
Metadata
Show full item record
DESENVOLVIMENTO DE FERRAMENTAS MOLECULARES RÁPIDAS E DE BAIXO CUSTO PARA O DIAGNÓSTICO DO VÍRUS ZIKA
Infecção pelo Zika virus/diagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/métodos
Técnicas Biossensoriais
Culicidae/virologia
Custos e Análise de Custo
Estudos de Avaliação
Sensibilidade e Especificidade
Insetos Vetores
Técnicas e Procedimentos Diagnósticos
Silva, Severino Jefferson Ribeiro da | Date Issued:
2019
Alternative title
Development of fast and low cost molecular tools for Zika virus diagnosisAdvisor
Co-advisor
Comittee Member
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Aggeu Magalhães. Recife, PE, Brasil.
Abstract in Portuguese
A rápida disseminação do vírus Zika (ZIKV) representa um problema de saúde pública
global, especialmente em países onde circulam várias espécies de mosquitos vetores e
apresentam condições favoráveis para a transmissão de vírus, como o Brasil. Nessas áreas, a
melhoria no controle do mosquito precisa ser uma prioridade, mas a vigilância do vírus nos
mosquitos ocorre de maneira ineficiente. Atualmente, a reação de transcriptase reversa
seguida da reação em cadeia da polimerase quantitativa (qRT-PCR) é o método padrão-ouro
para o diagnóstico molecular do ZIKV em amostras humanas e amostras de mosquitos.
Porém, essa técnica apresenta elevado custo e inúmeras limitações para o diagnóstico Pointof-
care (POC), o que dificulta sua aplicação e utilização para um grande número de amostras
e em regiões com infraestrutura laboratorial limitada. Diante desse cenário, permanece a
necessidade do desenvolvimento de novas plataformas que sejam capazes de detectar o ZIKV
de forma simples e prática no campo. Neste trabalho, foi desenvolvida e validada uma
plataforma de transcriptase reversa seguida de amplificação isotérmica mediada por alça (RTLAMP)
para a detecção de ZIKV em amostras de mosquitos. Quanto aos resultados, o ensaio
RT-LAMP foi altamente específico para detecção do ZIKV e se mostrou até 10.000 vezes
mais sensível que a qRT-PCR para a detecção do ZIKV em amostras de mosquito. A
validação do ensaio foi realizada com 60 amostras de mosquitos Aedes aegypti e Culex
quinquefasciatus, incluindo mosquitos artificialmente e naturalmente infectados. O RTLAMP
apresentou sensibilidade de 100%, especificidade de 91,18% e acurácia geral de
95,24%. Quanto ao custo de cada reação (teste) do RT-LAMP, o valor foi um real (R$ 1,00),
40 vezes mais barato do que o qRT-PCR. A disponibilização dessas ferramentas tem grande
potencial de contribuir para prevenir a propagação da doença na população e estabelecer
melhores estratégias de controle para combater esse patógeno devastador.
Abstract
The rapid spread of Zika virus (ZIKV) represents a global public health problem, especially in
countries that circulate several vector mosquito vectors and favorable conditions for virus
transmission, such as Brazil. In these areas, improvement in mosquito control needs to be a
top priority, but mosquito viral surveillance occurs inefficiently. Currently, the reverse
transcriptase reaction followed by quantitative polymerase chain reaction (qRT-PCR) is the
gold standard for molecular diagnostic of ZIKV in human samples and mosquito samples.
However, the technique presents high cost and limitations for Point-of-care (POC)
diagnostics, which makes it difficult to apply and use for a large number of samples and in
regions with limited laboratory infrastructure. In view of this scenario, there remains the need
to develop new platforms that are capable of detecting ZIKV in a simple and practical way in
the field. In this work, we developed and validated a platform reverse transcription loopmediated
isothermal amplification (RT-LAMP) for detection of ZIKV in mosquito samples.
Regarding the results, the RT-LAMP assay was highly specific for detection of ZIKV and was
up to 10,000 times more sensitive than qRT-PCR for the detection of ZIKV in mosquito
samples. Assay validation was performed using 60 samples from Aedes aegypti and Culex
quinquefasciatus, including artificially and naturally infected mosquitoes. The RT-LAMP had
a sensitivity of 100%, specificity of 91.18 %, and overall accuracy of 95.24%. The cost of
each reaction (test) of the RT-LAMP was one Brazilian Real (R$ 1.00). The availability of
these tools has great potential to contribute to prevent the spread of the disease in the
population and establish better control strategies for this devastating pathogen.
DeCS
Zika virus/isolamento & purificaçäoInfecção pelo Zika virus/diagnóstico
Reação em Cadeia da Polimerase Via Transcriptase Reversa/métodos
Técnicas Biossensoriais
Culicidae/virologia
Custos e Análise de Custo
Estudos de Avaliação
Sensibilidade e Especificidade
Insetos Vetores
Técnicas e Procedimentos Diagnósticos
Share