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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/33962
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EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR DO HIV-1 NO ESTADO DO CEARÁ, BRASIL
Gadelha, Sandra Rocha | Data do documento:
2002
Autor(es)
Orientador
Membros da banca
Afiliação
Universidade Federal da Bahia. Faculdade de Medicina. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Resumo
No Brasil, o HIV-1 é representado predominantemente por vírus do subtipo B, embora um aumento no número de vírus não Bs e recombinantes tem sido registrado. O HM A, baseado no gene env, tem sido muito usado neste país como ferramenta para monitorar a distribuição dos subtipos. Como a recombinação intersubtipo é uma importante fonte de variação genética do HIV-1 é de fundamental importância ampliar a subtipagem por HMA para duas regiões distintas do genoma do HIV: env e ga^. O principal objetivo deste trabalho é identificar subtipos circulantes do HIV-1 no estado do Ceará. Este estado está localizado na região Nordeste do Brasil, onde o turismo sexual e a prostituição infantil são fatores que favorecem a disseminação da epidemia do HIV. As amostras foram coletadas no Hospital São José, que é o maior hospital para HIV/AIDS no Ceará. Células mononucleares do sangue periférico foram separadas pela metodologia de Ficol-Hipaque e o DNA genômico extraído através da digestão com proteinase K, seguido de purificação com fenol- clorofórmio. O DNA genômico foi usado para amplificar fragmentos dos genes env e gag através de PCR. Foi utilizada a técnica de HMA para identificar os subtipos circulantes nessa população. Amostras correspondentes à variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR) foram identificadas por RFLP usando a enzima de restrição FokI. Foram analisamos 149 amostras positivas para HIV-1 coletadas no ano 2000. Os subtipos B, F e B/F foram identificados. A prevalência do subtipo B foi de 94% e a prevalência de ambos subtipo F e recombinante B/F de 3%. Baseado na análise com a enzima Fokl, 34% das amostras foram identificadas como a variante brasileira do subtipo B (motivo GWGR). Foi demonstrado, nesse estudo, uma predominância de subtipo B semelhante a estudos anteriores realizados com amostras da região sudeste do Brasil. Além disso, foi demonstrado, pela primeira vez, a presença de subtipo F e recombinante B/F no estado Ceará. Estes resultados contribuem para um conhecimento geral da epidemia do HIV no Brasil, fornecendo informações importantes para o planejamento de estratégias relevantes para a saúde pública em nosso país.
Resumo em Inglês
In Brazil HlV-1 is predominantly represented by subtype B viruses nevertheless an increasing number of non-B and few recombinants have being reported. HMA based on the env gene has been largely used in Brazil as a tool for monitoring subtype distribution. Since intersubtype recombination is an impoiiant sourcc of HIV-1 genetic variation it is of paramount importance to extend HMA subtyping using two distinct HIV regions; env e gag. The main goal of the present work is to identify circulating IIIV-I subtypes in Ceará State using env and gag HMA. Ceará state is located in the Northeast region of Brazil, where social problems such as sexual tourism and child prostitution represent enhancing factors to the spreading of HIV epidemics. Samples were collected at São José Hospital, which is the major hospital for HIV/AIDS in Ceará. PBMCs were separated by Ficol-Hypaque method and genomic i)NA extracted using protein-K digestion followed by phenol-chloroform purification. Genomic DNA was used to amplify fragments of the env and gag gene through PCR. These fragments were used in order to identify the circulating HIV-1 subtypes in this population using HMA. Samples corresponding to the typical Brazilian subtype B variant were further identified by RFLP using FokI restriction enzyme. We analyzed 149 HIV-1 positive samples collected along the year 2000. Subypes: B, F and B/l ’ were identified. The prevalence of subtype B was 94% and the prevalence of both subtype F and B/F recombinants were 3%. Based on FokI RFLP, 34% of the subtype B samples were ideaufied as corresponding to the typical Brazilian subtype B. We demonstrated a predominance of subtype B similar to previous results from studies done with samples from the southeast region of Brazil. In the present study we show for first time the presence of HIV-1 subtype F and B/F in Ceará State. Our results contribute to the overall knowledge of the HIV epidemics in Brazil Providing important information to support future planning for good public health care in our country.
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