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Artículo
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03 Saúde e Bem-Estar
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CIRCULATION OF CHIKUNGUNYA VIRUS EAST/CENTRAL/SOUTH AFRICAN LINEAGE IN RIO DE JANEIRO, BRAZIL
Xavier, Joilson et al. | Fecha del documento: 2019
Autor
Xavier, Joilson
Giovanetti, Marta
Fonseca, Vagner
Thézé, Julien
Gräf, Tiago
Fabri, Allison
Jesus, Jaqueline Goes de
Mendonça, Marcos Cesar Lima de
Rodrigues, Cintia Damasceno dos Santos
Mares-Guia, Maria Angélica
Santos, Carolina Cardoso dos
Tosta, Stephane Fraga de Oliveira
Candido, Darlan
Nogueira, Rita Maria Ribeiro
Abreu, Andre Luiz de
Oliveira, Wanderson Kleber
Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e
Chieppe, Alexandre
Oliveira, Tulio de
Brasil, Patrícia
Calvet, Guilherme
Sequeira, Patrícia Carvalho
Faria, Nuno Rodrigues
Filippis, Ana Maria Bispo de
Alcantara, Luiz Carlos Junior
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia Experimental. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / University of KwaZulu-Natal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa.
University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Centro de Ciências da Saúde. Instituto de Biologia. Departamento de Genética. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Laboratório de Patologia Experimental. Salvador, BA, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Organização Mundial da Saúde. Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil.
Superintendência de Vigilância do Estado. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of KwaZulu-Natal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Infectologia Evandro Chagas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Resumen en ingles
The emergence of chikungunya virus (CHIKV) has raised serious concerns due to the virus' rapid dissemination into new geographic areas and the clinical features associated with infection. To better understand CHIKV dynamics in Rio de Janeiro, we generated 11 near-complete genomes by means of real-time portable nanopore sequencing of virus isolates obtained directly from clinical samples. To better understand CHIKV dynamics in Rio de Janeiro, we generated 11 near-complete genomes by means of real-time portable nanopore sequencing of virus isolates obtained directly from clinical samples. Our phylogenetic reconstructions indicated the circulation of the East-Central-South-African (ECSA) lineage in Rio de Janeiro. Time-measured phylogenetic analysis combined with CHIKV notified case numbers revealed the ECSA lineage was introduced in Rio de Janeiro around June 2015 (95% Bayesian credible interval: May to July 2015) indicating the virus was circulating unnoticed for 5 months before the first reports of CHIKV autochthonous transmissions in Rio de Janeiro, in November 2015. These findings reinforce that continued genomic surveillance strategies are needed to assist in the monitoring and understanding of arbovirus epidemics, which might help to attenuate public health impact of infectious diseases.
Palabras clave en ingles
Chikungunya virus
East-Central-South-African lineage
Rio de Janeiro
Infection
Transmission
Public health
Humans
Brazil
 
Editor
Public Library of Science
Referencia
XAVIER, Joilson et al. Circulation of chikungunya virus East/Central/ South African lineage in Rio de Janeiro, Brazil. PLoS ONE, p. 1-14, 11 June 2019.
DOI
10.1371/journal.pone.0217871
ISSN
1932-6203