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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/26392
INTEGRATED ANALYSIS REVEALS THAT MIR-193B, MIR-671, AND TREM-1 CORRELATE WITH A GOOD RESPONSE TO TREATMENT OF HUMAN LOCALIZED CUTANEOUS LEISHMANIASIS CAUSED BY LEISHMANIA BRAZILIENSIS
microRNA
Skin
Transcriptome
TREM-1
Human leishmaniasis
Autor(es)
Nunes, Sara
Silva, Icaro Bonyek
Ampuero, Mariana Rosa
Noronha, Almério Libório Lopes de
Souza, Lígia Correia Lima de
Correia, Thaizza Cavalcante
Cunha, Antonio Ricardo Khouri
Boaventura, Viviane Sampaio
Barral, Aldina Maria Prado
Ramos, Pablo Ivan Pereira
Brodskyn, Claudia Ida
Oliveira, Pablo Rafael Silveira
Tavares, Natalia Machado
Silva, Icaro Bonyek
Ampuero, Mariana Rosa
Noronha, Almério Libório Lopes de
Souza, Lígia Correia Lima de
Correia, Thaizza Cavalcante
Cunha, Antonio Ricardo Khouri
Boaventura, Viviane Sampaio
Barral, Aldina Maria Prado
Ramos, Pablo Ivan Pereira
Brodskyn, Claudia Ida
Oliveira, Pablo Rafael Silveira
Tavares, Natalia Machado
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Laboratório de Anatomia Patológica. Feira de Santana, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centre for Data and Knowledge Integration for Health. Salvador, Ba, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centre for Data and Knowledge Integration for Health. Salvador, Ba, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Laboratório de Anatomia Patológica. Feira de Santana, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centre for Data and Knowledge Integration for Health. Salvador, Ba, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Centre for Data and Knowledge Integration for Health. Salvador, Ba, Brazil
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Resumo em Inglês
Localized cutaneous leishmaniasis (LCL) is a chronic disease characterized by ulcerated skin lesion(s) and uncontrolled inflammation. The mechanisms underlying the pathogenesis of LCL are not completely understood, and little is known about posttranscriptional regulation during LCL. MicroRNAs (miRNAs) are non-coding small RNAs that regulate gene expression and can be implicated in the pathogenesis of LCL. We investigated the involvement of miRNAs and their targets genes in human LCL using publicly available transcriptome data sets followed by ex vivo validation. Initial analysis highlighted that miRNA expression is altered during LCL, as patients clustered separately from controls. Joint analysis identified eight high confidence miRNAs that had altered expression (-1.5 ≤ fold change ≥ 1.5; p < 0.05) between cutaneous ulcers and uninfected skin. We found that the expression of miR-193b and miR-671 are greatly associated with their target genes, CD40 and TNFR, indicating the important role of these miRNAs in the expression of genes related to the inflammatory response observed in LCL. In addition, network analysis revealed that miR-193b, miR-671, and TREM1 correlate only in patients who show faster wound healing (up to 59 days) and not in patients who require longer cure times (more than 60 days). Given that these miRNAs are associated with control of inflammation and healing time, our findings reveal that they might influence the pathogenesis and prognosis of LCL.
Palavras-chave em inglês
Leishmania braziliensismicroRNA
Skin
Transcriptome
TREM-1
Human leishmaniasis
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