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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/25060
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2020-01-12
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IDENTIFICAÇÃO DE EPÍTOPOS DE PROTEÍNAS DO BACILO MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS CANDIDATOS A UMA NOVA VACINA CONTRA TUBERCULOSE
Santos, Alice Sarno Martins dos | Fecha del documento:
2017
Director
Miembros de la junta
Afiliación
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Resumen en portugues
INTRODUÇÃO: A tuberculose é uma das principais causas de morte, por doenças infecciosas, no mundo, apesar da vacina atualmente disponível, Bacillus Calmette-Guérin (BCG), ter ampla cobertura. Novas estratégias contra a tuberculose vêm sendo propostas, portanto, mas até o momento nenhum dos novos candidatos vacinais foi capaz de aumentar a proteção conferida pela vacina BCG. Em Salvador, nosso grupo pôde demonstrar a heterogeneidade na resposta imune, após a revacinação, potencialmente associada à eficácia moderada da vacina, nesta cidade. Foram ainda identificados um grupo de voluntários que apresentaram aumento expressivo (de pelo menos 3.3 vezes) na produção in vitro de interferon-gama (IFN-γ), citocina-chave para a resposta do hospedeiro contra o Mycobacterium tuberculosis, após a revacinação com BCG. Estes voluntários também reconheceram proteínas do M. tuberculosis, que não foram reconhecidas pelos demais grupos do estudo. Estas proteínas constituem candidatos a serem avaliados quanto à capacidade de produizirem uma resposta protetora contra a tuberculose. OBJETIVO: Neste sentido, buscamos avaliar que epítopos das mesmas poderiam estimular uma resposta de linfócitos T CD4+ nas populações humanas mais afetadas pela doença. Brasil, Rússia, Índia, China e África do Sul (BRICS) respondem por mais de metade dos casos de tuberculose no mundo. MATERIAL E MÉTODOS: Realizamos uma revisão sistemática da literatura, seguida de metanálise, para obtenção das frequências alélicas do gene HLA-DRB1 – envolvido diretamente na apresentação de antígenos do M. tuberculosis a linfóticos T CD4+ nas populações do BRICS. Em seguida, foram preditos epítopos das proteínas do M. tuberculosis, de acordo com a afinidade de ligação de cada um deles aos alelos mais frequentes, nos países estudados. RESULTADOS: Foram acessados 1734 artigos, durante a revisão sistemática, e incluídos 57 artigos, na metanálise, de todos os países. Os alelos HLA-DRB1*04, *07, *11, *13 e *15 estiveram entre os mais frequentes nas cinco populações. Identificamos 32 subtipos alélicos mais frequentes, para os quais foram preditos 21 peptídeos. Estes resultados foram submetidos a análise interna de viabilidade patentária pela Fundação Oswaldo Cruz. CONCLUSÃO: Proteínas do bacilo M. tuberculosis apresentam, em suas sequências, 5 ou 6 regiões peptídicas com alta afinidade de ligação para os subtipos alélicos mais frequentes do gene HLA-DRB1, com cobertura de cerca de 80% das populações de Brasil, Rússia, Índia, China e África do Sul.
Resumen en ingles
INTRODUCTION: Tuberculosis is one of the leading causes of death due to infectious diseases in the world, despite the currently available vaccine, Bacillus Calmette-Guérin (BCG), have wide coverage. New strategies against tuberculosis have therefore been proposed, but so far none of the new vaccine candidates have been able to increase the protection conferred by the BCG vaccine. In Salvador, our group was able to demonstrate the heterogeneity in the immune response after revaccination, potentially associated with the moderate efficacy of the vaccine in this city. We also identified a group of volunteers who presented an expressive increase (at least 3.3-fold) in the in vitro production of interferon-gamma (IFN-γ), a key cytokine for host response against Mycobacterium tuberculosis after BCG revaccination. These volunteers also recognized M. tuberculosis proteins, which were not recognized by the other study groups. These proteins are candidates for evaluation of their ability to produce a protective response against tuberculosis. AIM: Thereby we tried to evaluate which epitopes could stimulate a CD4+ T lymphocytes response in the human populations most affected by the disease. Brazil, Russia, India, China and South Africa (BRICS) account for more than half of all tuberculosis cases in the world. MATERIALS AND METHODS: We performed a systematic review of the literature, followed by meta-analysis, to obtain the allelic frequencies of the HLA-DRB1 gene - directly involved in the presentation of antigens of M. tuberculosis to CD4+ T lymphocytes in the BRICS populations. Next, epitopes of M. tuberculosis proteins were predicted, according to the binding affinity of each of them to the most frequent alleles in the studied countries. RESULTS: A total of 1734 articles were accessed during the systematic review, and 57 articles were included in the meta-analysis. The HLA-DRB1 * 04, * 07, * 11, * 13 and * 15 alleles were among the most frequent in all five populations. We identified 32 more frequent allelic subtypes, for which 21 peptides were predicted. These results were submitted to an internal feasibility analysis by the Oswaldo Cruz Foundation. CONCLUSION: M. tuberculosis proteins present in their sequences 5 or 6 peptide regions with high binding affinity for the most common allelic subtypes of the HLA-DRB1 gene, covering about 80% of the populations from Brazil, Russia, India, China and South Africa.
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