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SNP TYPING REVEALS SIMILARITY IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS GENETIC DIVERSITY IN PORTUGAL AND NORTHEAST BRAZIL
Polimorfismo de nucleotídeo único
Genética
Brasil
Portugal
Single nucleotide polymorphisms
Genetic
Brazil
Portugal
Autor(es)
Lopes, Joao Sollari Allegro Machado
Marques, I
Soares, Patricia
Guimaraes, H
Costa, J
Miranda, A
Alves, A
Macedo, R
Antunes, A. F
Duarte, Tonya Azevedo
Barbosa, Theolis Costa
Nery, Joilda Silva
Boechat, Neio
Pereira, Susan Martins
Barreto, Maurício Lima
Leal, J. Pereira
Gomes, Maria Gabriela Miranda
Penha, Goncalves C
Marques, I
Soares, Patricia
Guimaraes, H
Costa, J
Miranda, A
Alves, A
Macedo, R
Antunes, A. F
Duarte, Tonya Azevedo
Barbosa, Theolis Costa
Nery, Joilda Silva
Boechat, Neio
Pereira, Susan Martins
Barreto, Maurício Lima
Leal, J. Pereira
Gomes, Maria Gabriela Miranda
Penha, Goncalves C
Afiliação
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Nacional de Saude Dr. Ricardo Jorge. Porto, Portugal
Instituto Nacional de Saude Dr. Ricardo Jorge. Porto, Portugal
Direccao Geral da Saude. Lisboa, Portugal
Direccao Geral da Saude. Lisboa, Portugal
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Nacional de Saude Dr. Ricardo Jorge. Porto, Portugal
Instituto Nacional de Saude Dr. Ricardo Jorge. Porto, Portugal
Direccao Geral da Saude. Lisboa, Portugal
Direccao Geral da Saude. Lisboa, Portugal
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal do Rio de Janeiro. Rio de Janeiro, RJ, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Universidade Federal da Bahia. Salvador, BA, Brasil
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Instituto Gulbenkian de Ciencia. Oeiras, Portugal
Resumo em Inglês
Introduction: Human tuberculosis is an infectious disease primarily caused by Mycobacterium
tuberculosis (Mtb). At the moment, the gold standard of epidemiological genotyping of Mtb is Spoligtyping
and MIRU-VNTR. These markers, however, have limited use for phylogenetics and strain identification
since their fast substitution rate leads to convergent evolution. Recent studies have introduced the use of
single nucleotide polymorphisms (SNP) data for identification of Mtb strain groups. In this work we use
SNP typing techniques to characterize and compare Mtb populations from Portugal and Brazil. We
complement this analysis by discussing the benefits and caveats of this technique.
Palavras-chave
Mycobacterium tuberculosisPolimorfismo de nucleotídeo único
Genética
Brasil
Portugal
Palavras-chave em inglês
Mycobacterium tuberculosisSingle nucleotide polymorphisms
Genetic
Brazil
Portugal
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