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IDENTIFICATION OF TWO PHYLOGENETIC LINEAGES OF EQUINE HEPACIVIRUS AND HIGH PREVALENCE IN BRAZIL
Figueiredo, Andreza Soriano et al. | Data do documento: 2015
Autor(es)
Figueiredo, Andreza Soriano
Lampe, Elisabeth
Espírito Santo, Márcia Paschoal do
Mello, Francisco Campello do Amaral
Almeida, Fernando Queiroz de
Lemos, Elba Regina Sampaio de
Godoi, Tatianne Leme Oliveira Santos
Dimache, Luana Avila Giorgia
Santos, Debora Regina Lopes dos
Villar, Livia Melo
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hepatites Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hepatites Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hepatites Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hepatites Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Veterinária. Seropédica, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hantaviroses e Rickettsioses. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Animais. Seropédica, RJ, Brasil.
Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Instituto de Ciências Animais. Seropédica, RJ, Brasil.
Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. Departamento de Microbiologia Veterinária e Imunologia. Seropédica, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Hepatites Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Resumo em Inglês
Non-primate hepacivirus (NPHV), as described in horses, is the virus most genetically related to hepatitis C virus (HCV). Although detected worldwide, limited data on genomic variability and distribution of NPHV are available in Latin America. The aim of this study was to investigate the genetic diversity and prevalence of equine NPHV in Brazil. Thirteen percent of 202 equines from three Brazilian states were positive for NPHV genome by reverse transcriptase PCR. Nucleotide sequences of the partial NS5B genome presented the greatest diversity described to date (25.6%), which is comparable to the upper limit of diversity for HCV subtype classification for the same region. Phylogenetic analysis revealed that Brazilian NPHV sequences along with isolates worldwide form two strongly supported clades (pp = 1.0) suggesting the existence of two distinct lineages.
Palavras-chave em inglês
Brazil
Horse
Non-primate hepacivirus
Nucleotide distance
Subtype classification
 
DeCS
Hepacivirus
Cavalos
 
Editor
Elsevier
Referência
FIGUEIREDO, Andreza Soriano; et al. Identification of two phylogenetic lineages of equine hepacivirus and high prevalence in Brazil. The Veterinary Journal, v.206, n.3, p.414-416, Dec. 2015.
DOI
10.1016/j.tvjl.2015.10.015
ISSN
1090-0233