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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/12133
DRAFT GENOME SEQUENCES OF TWO SPECIES OF "DIFFICULT-TO-IDENTIFY" HUMAN-PATHOGENIC CORYNEBACTERIA: IMPLICATIONS FOR BETTER IDENTIFICATION TESTS
Patógenos Emergentes
Testes Bioquímicos
Identificação Molecular
Author
Pacheco, Luis Gustavo Carvalho
Guaraldi, Ana Luíza Mattos
Santos, Carolina S.
Veras, Adonney A. O.
Guimarães, Luis, C.
Abreu, Vinicius Augusto Carvalho de
Pereira, Felipe L.
Soares, Simoar de Carvalho
Dorella, Fernanda Alves
Carvalho, Alex F.
Leal, Carlos G.
Figueiredo, Henrique C.
Ramos, Juliana Nunes
Vieira, Verônica Viana
Farfour, Eric
Guiso, Nicole
Hirata Junior, Raphael
Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho
Silva, Artur
Ramos, Rommel Thiago Juca
Guaraldi, Ana Luíza Mattos
Santos, Carolina S.
Veras, Adonney A. O.
Guimarães, Luis, C.
Abreu, Vinicius Augusto Carvalho de
Pereira, Felipe L.
Soares, Simoar de Carvalho
Dorella, Fernanda Alves
Carvalho, Alex F.
Leal, Carlos G.
Figueiredo, Henrique C.
Ramos, Juliana Nunes
Vieira, Verônica Viana
Farfour, Eric
Guiso, Nicole
Hirata Junior, Raphael
Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho
Silva, Artur
Ramos, Rommel Thiago Juca
Affilliation
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Institut Pasteur. Unité de Prévention et Thérapie Moléculaires des Maladies Humaines. Paris, France.
Institut Pasteur. Unité de Prévention et Thérapie Moléculaires des Maladies Humaines. Paris, France.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal da Bahia. Instituto de Ciências da Saúde. Salvador, BA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Laboratório de Referência Nacional para Doenças dos Animais Aquáticos. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Departamento de Microbiologia. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Institut Pasteur. Unité de Prévention et Thérapie Moléculaires des Maladies Humaines. Paris, France.
Institut Pasteur. Unité de Prévention et Thérapie Moléculaires des Maladies Humaines. Paris, France.
Universidade do Estado do Rio de Janeiro. Faculdade de Ciências Médicas. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Belém, PA, Brasil.
Abstract
Non-diphtheriae Corynebacterium species have been increasingly recognized as the causative agents of infections in humans. Differential identification of these bacteria in the clinical microbiology laboratory by the most commonly used biochemical tests is challenging, and normally requires additional molecular methods. Herein, we present the annotated draft genome sequences of two isolates of “difficult-to-identify” human-pathogenic corynebacterial species: C. xerosis and C. minutissimum. The genome sequences of ca. 2.7 Mbp, with a mean number of 2,580 protein encoding genes, were also compared with the publicly available genome sequences of strains of C. amycolatum and C. striatum. These results will aid the exploration of novel biochemical reactions to improve existing identification tests as well as the development of more accurate molecular identification methods through detection of species-specific target genes for isolate's identification or drug susceptibility profiling.
Keywords in Portuguese
Corynebacterium sppPatógenos Emergentes
Testes Bioquímicos
Identificação Molecular
Publisher
Ivyspring International Publisher
Citation
PACHECO, L. G. et al. Draft Genome Sequences of Two Species of "Difficult-to-Identify" Human-Pathogenic Corynebacteria: Implications for Better Identification Tests. J. Genomics, v. 3, p. 82-84, 2015.DOI
10.7150/jgen.12886ISSN
1839-9940Related items
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