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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/11136
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DissertaçãoDireito Autoral
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VIGILÂNCIA AMBIENTAL DOS POLIOVÍRUS, NO MUNICÍPIO DO RIO DE JANEIRO, EM APOIO ÀS ATIVIDADES DE ERRADICAÇÃO GLOBAL DA POLIOMIELITE
Pereira, Joseane Simone de Oliveira | Data do documento:
2013
Título alternativo
Enviromental surveilance of polioviruses in Rio de Janeiro city in support to the activities of global polio eradicationAutor(es)
Orientador
Membros da banca
Afiliação
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde
Resumo
A poliomielite é uma infecção causada por um dos três sorotipos de poliovírus (sorotipos 1, 2 e 3) e teve sua incidência diminuída drasticamente (>99%) pelo programa de erradicação global da doença, iniciado em 1988. Atualmente, estes vírus permanecem endêmicos em três países e casos de re-emergência por importação têm sido relatados em países livres da doença. O presente trabalho teve como objetivo estabelecer a vigilância ambiental pelo isolamento e caracterização molecular dos poliovírus e enterovírus não-pólio circulantes, a partir de amostras de esgoto coletadas na Estação de Tratamento de Esgoto (ETE) Alegria/Cedae, localizada no município do Rio de Janeiro, no período de dezembro de 2011 a junho de 2012 e de setembro a dezembro de 2012. Diferentes métodos de concentração viral foram avaliados (separação em duas fases; precipitação por polietilenoglicol (PEG) e adsorção por sílica) e 31 amostras foram coletadas durante o estudo. O isolamento em culturas de células RD e L20B, seguido de RT-PCR foi capaz de detectar enterovírus em 87% das amostras (27/31). Poliovírus foram isolados em 29,6 % (8/27), sendo Sabin 1 - n= 1; Sabin 2 - n= 5 e Sabin 3 - n= 2, enquanto que os demais isolados foram identificados como enterovírus não-pólio. Todos os poliovírus isolados foram submetidos ao sequenciamento nucleotídico completo do gene VP1 e apresentaram mutações sinônimas e não-sinônimas, sendo algumas em aminoácidos específicos relacionados ao fenótipo atenuado. Todavia, não apresentaram mutações suficientes para serem caracterizados como poliovírus derivado da vacina (PVDV), sendo, portanto, classificados como vacinais ou Sabin like.
Resumo em Inglês
Poliomyelitis is an infection caused by one of three poliovirus serotypes (serotypes 1, 2 and 3) and its incidence decreased dramatically (> 99%) by the global polio eradication initiative, started in 1988. Currently, wild polioviruses remain endemic in three countries and cases of re-emergency by import of these viruses have been related in countries free of the disease. This study aimed to establish the environmental surveillance by the isolation and molecular characterization of circulating poliovirus and non-polio enteroviruses from wastewater samples collected at the Station of Sewage Treatment Alegria/ Cedae, located in Rio de Janeiro city, in the period from December 2011 to June 2012 and from September to December 2012. Different methods of viral concentration were evaluated (two-phases separate, polyethylene glycol (PEG) precipitation and silica adsorption) and 31 samples were collected during the study. The isolation in cell cultures RD and L20B, followed by RT-PCR was able to detect enteroviruses in 87% samples (27/31). Poliovirus was isolated in 29.6% samples (8/27) being Sabin1 - n= 1, Sabin 2 - n= 5 and Sabin 3 - n= 2, while the remaining isolates were non-polio enteroviruses. All poliovirus isolates were subjected to complete nucleotide sequencing of the VP1 gene and presented non-synonymous and synonymous mutations, being some mutations in specific amino acids related to the attenuated phenotype. However, showed no sufficient mutations for to be characterized like vaccine-derived poliovirus (VDPV), being classified as vaccine or Sabin like poliovirus. By the partial nucleotide sequencing of the VP1 gene analysis, the non-polio enteroviruses have been identified: 1 Echovirus 3; 11 Echovirus 6, 7 Echovirus 7, 2 Echovirus 20; 4 Coxsackievirus B4 and 2 Coxsackievirus B5. Environmental surveillance has been utilized successfully in monitoring the circulation of enterovirus and it is of crucial importance in the final stages of the global eradication initiative of polio by Word Health Organization (WHO). These results show the continuous circulation of Sabin like poliovirus and non-polio enteroviruses in the analyzed area during the study period.
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