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Title: Caracterização genética de isolados clínicos e ambientais de Klebsiella pneumoniae
Advisor: Vicente, Ana Carolina Paulo
Members of the board: Barroso, David
Picão, Renata
Suffys, Philip
Authors: Lima, Patricia Mayer
Affilliation: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract: Klebsiella sp. é uma bactéria ubíqua, responsável por infecções nosocomiais oportunistas. Linhagens multirresistentes a antibióticos têm se tornado um problema cada vez mais freqüente no mundo todo. Estudos objetivando a determinação do potencial patogênico dos isolados ambientais são escassos. K. pneumoniae de origem ambiental poderia estar atuando como reservatório de genes de resistência que eventualmente poderiam ser transferidos e levar ao aparecimento linhagens multirresistentes. Nosso objetivo é determinar o perfil de resistência aos antimicrobianos de isolados clínicos e ambientais de K. pneumoniae, determinar os genótipos circulantes e sua clonalidade e caracterizar a genética da resistência observada. A susceptibilidade a 9 classes de antibióticos foi determinada para os 76 isolados clínicos e ambientais. De modo geral, os isolados clínicos mostraram-se resistentes a maioria das classes de antibióticos testadas, enquanto os isolados ambientais mostraram-se suscetíveis às diferentes classes. A pesquisa por elementos genéticos associados a resistência a antibióticos mostrou a presença de integron de classe 1 entre os isolados clínicos e integron de classe 2 em isolados ambientais. Os principais cassetes identificados no integron de classe 1 foram acetilt- e adenil-transferases ou dihidrofolatoredutase, os cassetes mais frequentemente encontrados nessa classe. No integron de classe 2, foi caracterizado o arranjo sat-aadA. Essa é a primeira identificação de integron de classe 2 em isolado ambiental de K. pneumoniae. A caracterização da relação genética entre os isolados, utilizando MLST, mostrou a existência de 45 sequencias-tipo(STs), das quais 24 novas. A análise por MLST mostrou que existe uma linhagem principal, distribuída pelo Brasil. Identificamos STs pandêmicos: ST11, ST23, ST37, ST423 e ST437 e sua distribuição mostra a existência de complexos clonais distribuídos em diferentes regiões geográficas do Brasil.
Abstract: Klebsiella sp. Are ubiquitous bacteria associated with opportunistic nosocomial infections. Multiresistant strains to antibiotics have become an increasingly common problem worldwide. Studies focused on determining the pathogenic potential of environmental isolates are scarce. K. pneumoniae environmental strains could be acting as reservoirs of resistance genes that could be transferred and eventually lead to the emergence of multiply antibiotic-resistant strains. Our aim is to determine the antimicrobial resistance profiles of clinical and environmental K. pneumoniae strains, characterize the circulating genotypes and their clonality, and investigate the presence of genetic elements associated with the resistance observed, in Brazil. The susceptibility to nine classes of antibiotics was determined for 76 clinical and environmental isolates. There is a prevalence of the multidrug resistant phenotype (MDR) within the clinical isolates, whilst the environmental isolates are susceptible to different classes of antibiotics. The search for genetic elements associated with antibiotic resistance revealed the presence of class 1 and class 2 integrons among clinical and environmental isolates, respectively. The main gene cassettes present in class 1 integrons were aac and aad (acetylt- and adenyl-transferases) or dfr (dihydrofolateredutase), the most commonly found in class 1 integrons. The class 2 integron harbored the sat-aadA arrangement. This is the first observation of class 2 integrons in environmental K. pneumoniae isolates. Using the MLST approach, the genetic relationship among the strains showed 45 sequence-types (STs), of which 24 have not been described yet. The MLST analysis revealed a major K. pneumoniae lineage distributed throughout Brazil. Pandemic STs were identified among the clinical strains: ST11, ST23, ST37, ST423 and ST437. Their distribution shows the existence of clonal complexes throughout geographic regions of Brazil.
Keywords: Cross Infection /virology
Anti-Infective Agents /immunology
Drug Resistance, Microbial /immunology
keywords: Infecção Hospitalar /virologia
Anti-Infecciosos /imunologia
Resistência Microbiana a Medicamentos /imunologia
DeCS: Infecção Hospitalar /virologia
Anti-Infecciosos /imunologia
Resistência Microbiana a Medicamentos /imunologia
Issue Date: 2011
Citation: LIMA, Patricia Mayer. Caracterização genética de isolados clínicos e ambientais de Klebsiella pneumoniae. 2011. 102 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Parasitária) – Instituto Oswaldo Cruz, 2011.
Date of defense: 2011
Place of defense: Rio de Janeiro / RJ
Defense institution: Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz.
Program: Curso de Pós-Graduação em Biologia Parasitária
Copyright: open access
Appears in Collections:IOC - PGBP - Dissertações de Mestrado

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