Author | Santos Junior, Joilson Xavier dos | |
Author | Giovanetti, Marta | |
Author | Adelino, Talita Émile Ribeiro | |
Author | Fonseca, Vagner de Souza | |
Author | Costa, Alana Vitor Barbosa da | |
Author | Ribeiro, Adriana Aparecida | |
Author | Felicio, Katlin Nascimento | |
Author | Duarte, Clara Guerra | |
Author | Silva, Marcos Vinicius Ferreira | |
Author | Abreu, Álvaro Salgado de | |
Author | Lima, Mauricio Teixeira | |
Author | Jesus, Ronaldo de | |
Author | Fabri, Allison de Araujo | |
Author | Zoboli, Cristiane Franco Soares | |
Author | Santos, Thales Gutemberg Souza | |
Author | Iani, Felipe Campos de Melo | |
Author | Ciccozzi, Massimo | |
Author | Filippis, Ana Maria Bispo de | |
Author | Siqueira, Marilda Agudo Mendonça Teixeira de | |
Author | Abreu, André Luiz de | |
Author | Azevedo, Vasco Ariston de Carvalho | |
Author | Ramalho, Dario Brock | |
Author | Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e | |
Author | Oliveira, Tulio de | |
Author | Holmes, Edward C. | |
Author | Lourenço, José | |
Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
Author | Oliveira, Marluce Aparecida Assunção | |
Access date | 2024-01-25T15:36:42Z | |
Available date | 2024-01-25T15:36:42Z | |
Document date | 2020 | |
Citation | SANTOS JUNIOR, Joilson Xavier dos et al. The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing. Emerging Microbes & Infections, v. 9, p. 1824-1834, 11 Aug. 2020. | en_US |
ISSN | 2222-1751 | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/62373 | |
Description | A Rede Genômica Fiocruz é formada por especialistas de todas as unidades da Fundação no país e de institutos parceiros que se empenham diariamente em gerar dados mais robustos sobre o comportamento do SARS-Cov-2 e contribuir para um melhor preparo do país no enfrentamento da pandemia em termos de diagnóstico mais precisos e vacinas eficazes. Saiba mais sobre a Rede Genômica Fiocruz em: http://www.genomahcov.fiocruz.br/ | |
Sponsorship | Pan American World Health Organization (VPGDI-003-FIO-19-2-2-30) | en_US |
Sponsorship | M.G. is supported by Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro (FAPERJ) | |
Sponsorship | V.F. and T.d.O. are supported by the South African Medical Research Council (MRC-RFA-UFSP-01-2013/UKZN HIVEPI) and the NIH H3Abi-oNet network, which is an initiative of the Human Health and Heredity in Africa Consortium (H3Africa) | |
Sponsorship | E.C.H. is supported by an Australian Research Council Australian Laureate Fellowship (FL170100022) | |
Sponsorship | J.L. is supported by a lectureship from the Department of Zoology, University of Oxford. J.X. | |
Sponsorship | F.I. are supported by the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior – Brasil
(CAPES) – Finance Code 001. F.I. is also supported by Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais (FAPEMIG) | |
Sponsorship | A.S. has a scholarship from ZIKA - Announcement MCTIC/FNDCT-CNPq/MEC-CAPES/MS-Decit /No. 14/2016 - Prevention and Fight against Zika Virus | |
Sponsorship | M.T.L. is supported by Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPQ) | |
Sponsorship | V.A. has a grant from the Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) #88887.506611/202-00) | |
Language | eng | en_US |
Publisher | Taylor and Francis Group | en_US |
Previous version | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/43407 | en_US |
Rights | open access | en_US |
Title | The ongoing COVID-19 epidemic in Minas Gerais, Brazil: insights from epidemiological data and SARS-CoV-2 whole genome sequencing | en_US |
Type | Article | en_US |
DOI | 10.1080/22221751.2020.1803146 | |
Abstract | The recent emergence of a coronavirus (SARS-CoV-2), first identified in the Chinese city of Wuhan in December 2019, has had major public health and economic consequences. Although 61,888 confirmed cases were reported in Brazil by 28 April 2020, little is known about the SARS-CoV-2 epidemic in this country. To better understand the recent epidemic in the second most populous state in southeast Brazil - Minas Gerais (MG) - we sequenced 40 complete SARS-CoV-2 genomes from MG cases and examined epidemiological data from three Brazilian states. Both the genome analyses and the geographical distribution of reported cases indicate for multiple independent introductions into MG. Epidemiological estimates of the reproductive number (R) using different data sources and theoretical assumptions suggest the potential for sustained virus transmission despite a reduction in R from the first reported case to the end of April 2020. The estimated date of SARS-CoV-2 introduction into Brazil was consistent with epidemiological data from the first case of a returned traveller from Lombardy, Italy. These findings highlight the nature of the COVID-19 epidemic in MG and reinforce the need for real-time and continued genomic surveillance strategies to better understand and prepare for the epidemic spread of emerging viral pathogens. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Università Campus Bio-Medico. Roma, Italia. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Vírus Respiratórios, Exantemáticos, Enterovírus e Emergências Virais. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Secretaria de Estado de Saúde de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Mundial da Saúde. Organização Pan-Americana da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | University of KwaZuluNatal. College of Health Sciences. KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform. Durban, South Africa. | en_US |
Affilliation | University of Sydney. School of Life and Environmental Sciences and School of Medical Sciences. Marie Bashir Institute for Infectious Diseases and Biosecurity. Sydney, NSW, Australia. | en_US |
Affilliation | University of Oxford. Department of Zoology. Oxford, UK. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Departamento de Genética, Ecologia e Evolução. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Subject | SARS-CoV-2 | en_US |
Subject | Genomic surveillance | en_US |
Subject | Minas Gerais | en_US |
Subject | Southeast Brazil | en_US |
Subject | Pandemic | en_US |
Subject | Sequencing | en_US |
Subject | Genomic epidemiology | en_US |
DeCS | COVID-19 | en_US |
e-ISSN | 2222-1751 | |