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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/61460
VIGILÂNCIA GENÔMICA AMBIENTAL DE SARS-COV-2 EM ÁGUAS RESIDUAIS NO RIO DE JANEIRO
patogenicidade
Águas Residuárias
análise
Monitoramento Biológico
métodos
Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias
patogenicidade
Águas Residuárias
análise
Monitoramento Biológico
métodos
Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias
Brito, Andressa Silva Gonçalves de Brito | Date Issued:
2023
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde. Rio de Janeiro, RJ, Brasil.
Abstract in Portuguese
A doença do coronavírus 2019 (COVID-19) é uma doença infecciosa causada pela síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2) e tem como principais sintomas febre, cansaço e tosse seca e problemas gastrointestinais. O RNA do SARS-CoV-2 pode ser detectado em fezes de indivíduos sintomáticos e assintomáticos e pode ser transportado indiretamente para ambientes aquáticos e estações de tratamento de águas residuais. O estudo de vírus em águas residuais é uma ferramenta útil conhecida como Wastewater Based Epidemiology (WBE) e tem o potencial de atuar como uma abo500rdagem complementar aos atuais sistemas de vigilância genômica clínica, atuando como uma abordagem promissora capaz de fornecer informações importantes sobre a disseminação e mutações do SARS-CoV-2, além de gerar alerta precoce para identificar novos surtos da doença. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade genética de SARS-CoV-2 em duas estações de tratamento de águas residuais no município do Rio de Janeiro por meio da vigilância genômica ambiental utilizando a abordagem de WBE. Para isso, foram selecionadas duas estações de tratamento de águas residuais hospitalar (ETAR1) e mista (ETAR2). Durante o período de janeiro a dezembro/2021 foram realizadas coletas semanais, totalizando 152 amostras, 76 da ETAR1 e 76 da ETAR2. As amostras foram submetidas a concentração com PEG8000 e a detecção do RNA do SARS-CoV-2 foi realizada utilizando iniciadores do gene E e N1. Na ETAR1, 47,4% (36/76) das amostras do afluente e efluente apresentaram o gene E. As amostras negativas para o gene E (n=40), foram avaliadas quanto a presença do gene N1, onde 11,6% (13/40) das amostras da ETAR1 apresentaram o gene N1 afluente e efluente. A ETAR2 teve apenas 5,3% (4/76) de amostras positivas onde o gene E e foi o único presente. As amostras semanais da ETAR1 foram agrupadas de acordo com o mês de coleta durante todo o período do estudo. Não foi possível recuperar o genoma completo de nossas amostras, entretanto, análises realizadas em software Viralflow e banco de dados como o Pango, GISAID, Nextclade e OMS, sugerem possíveis variantes do SARS-CoV-2 com base nas mutações características. A detecção de SARS-CoV-2 em águas residuais, pode servir como ferramenta para monitorar a prevalência e a epidemiologia em determinada comunidade, auxiliando a compreensão da disseminação do vírus entre a população. Sendo assim, a vigilância epidemiológica baseada em águas residuais, serve como uma abordagem complementar no monitoramento de sua prevalência, diversidade genética e distribuição geográfica.
Keywords in Portuguese
SARS-CoV-2patogenicidade
Águas Residuárias
análise
Monitoramento Biológico
métodos
Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias
DeCS
SARS-CoV-2patogenicidade
Águas Residuárias
análise
Monitoramento Biológico
métodos
Vigilância Epidemiológica Baseada em Águas Residuárias
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