Author | Xavier, Joilson | |
Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
Author | Fonseca, Vagner | |
Author | Lima, Mauricio | |
Author | Castro, Emerson | |
Author | Fritsch, Hegger | |
Author | Oliveira, Carla | |
Author | Guimarães, Natalia | |
Author | Adelino, Talita | |
Author | Evaristo, Mariane | |
Author | Rodrigues, Evandra S. | |
Author | Santos, Elaine Vieira | |
Author | La-Roque, Debora de | |
Author | Moraes, Laise de | |
Author | Tosta, Stephane | |
Author | Neto, Adelino | |
Author | Rosewell, Alexander | |
Author | Mendonça, Ana Flavia | |
Author | Leite, Anderson | |
Author | Vasconcelos, Andreza | |
Author | Mello, Arabela L. Silva de | |
Author | Vasconcelos, Bergson | |
Author | Montalbano, Camila A. | |
Author | Zanluca, Camila | |
Author | Freitas, Carla | |
Author | Albuquerque, Carlos F. C. de | |
Author | Santos, Claudia Nunes Duarte dos | |
Author | Santos, Cleiton S. | |
Author | Santos, Cliomar Alves dos | |
Author | Gonçalves, Crhistinne C. Maymone | |
Author | Teixeira, Dalane | |
Author | Neto, Daniel F. L. | |
Author | Cabral, Diego | |
Author | Oliveira, Elaine C. de | |
Author | Maciel, Ethel L. Noia | |
Author | Pereira, Felicidade Mota | |
Author | Iani, Felipe | |
Author | Carvalho, Fernanda P. de | |
Author | Andrade, Gabriela | |
Author | Bezerra, Gabriela | |
Author | Lichs, Gislene G. de Castro | |
Author | Pereira, Glauco Carvalho | |
Author | Barroso, Haline | |
Author | Franz, Helena Cristina Ferreira | |
Author | Ferreira, Hivylla | |
Author | Gomes, Iago | |
Author | Riediger, Irina N. | |
Author | Rodrigues, Isabela | |
Author | Siqueira, Isadora C. de | |
Author | Silva, Jacilane | |
Author | Rico, Jairo Mendez | |
Author | Lima, Jaqueline | |
Author | Abrantes, Jayra | |
Author | Nascimento, Jean Phellipe M. do | |
Author | Wasserheit, Judith N. | |
Author | Pastor, Julia | |
Author | Magalhães, Jurandy J. F. de | |
Author | Luz, Kleber Giovanni | |
Author | Neto, Lidio Gonçalves Lima | |
Author | Frutuoso, Livia C. V. | |
Author | Silva, Luana Barbosa da | |
Author | Sena, Ludmila | |
Author | Sousa, Luis Arthur F. de | |
Author | Pereira, Luiz Augusto | |
Author | Demarchi, Luiz | |
Author | Câmara, Magaly C. B. | |
Author | Astete, Marcela G. | |
Author | Almiron, Maria | |
Author | Lima, Maricelia | |
Author | Zardin, Marina C. S. Umaki | |
Author | Presibella, Mayra M. | |
Author | Falcão, Melissa B. | |
Author | Gale Jr., Michael | |
Author | Freire, Naishe | |
Author | Marques, Nelson | |
Author | Moura, Noely F. O. de | |
Author | Rabinowitz, Peter | |
Author | Cunha, Rivaldo V. da | |
Author | Trinta, Karen S. | |
Author | Said, Rodrigo F. do Carmo | |
Author | Kato, Rodrigo | |
Author | Stabeli, Rodrigo | |
Author | Jesus, Ronaldo de | |
Author | Santos, Roselene Hans | |
Author | Kashima, Simone | |
Author | Slavov, Svetoslav N. | |
Author | Andrade, Tamires | |
Author | Rocha, Themis | |
Author | Carneiro, Thiago | |
Author | Nardy, Vanessa | |
Author | Silva, Vinicius da | |
Author | Carvalho, Walterlene G. | |
Author | Voorhis, Wesley C. Van | |
Author | Araujo, Wildo N. | |
Author | Filippis, Ana M. B. de | |
Author | Giovanetti, Marta | |
Access date | 2023-08-24T15:38:54Z | |
Available date | 2023-08-24T15:38:54Z | |
Document date | 2023 | |
Citation | XAVIER, Joilson et al. Increased interregional virus exchange and nucleotide diversity outline the expansion of chikungunya virus in Brazil. Nature Communications. v. 14, n. 4413, p. 1-12, 2023. | en_US |
ISSN | 2041-1723 | en_US |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/60208 | |
Language | por | en_US |
Publisher | Nature Research | en_US |
Rights | open access | en_US |
Subject in Portuguese | ADAR | en_US |
Title | Increased interregional virus exchange and nucleotide diversity outline the expansion of chikungunya virus in Brazil | en_US |
Type | Article | en_US |
DOI | https://doi.org/10.1038/s41467-023-40099-y | |
Abstract | The emergence and reemergence of mosquito-borne diseases in Brazil such as yellow fever, zika, chikungunya, and dengue have had serious impacts on public health. Concerns have been raised due to the rapid dissemination of the chikungunya virus across the country since its first detection in 2014 in Northeast Brazil. In this work, we carried out on-site training activities in genomic surveillance in partnership with the National Network of Public Health Laboratories that have led to the generation of 422 chikungunya virus genomes from 12 Brazilian states over the past two years (2021–2022), a period that has seen more than 312 thousand chikungunya fever cases reported in the country. These genomes increased the amount of available data and allowed a more comprehensive characterization of the dispersal dynamics of the chikungunya virus East-Central-South-African lineage in Brazil. Tree branching patterns revealed the emergence and expansion of two distinct subclades. Phylogeographic analysis indicated that the northeast region has been the leading hub of virus spread towards other regions. Increased frequency of C > T transitions among the new genomes suggested that host restriction factors from the immune system such as ADAR and AID/APOBEC deaminases might be driving the genetic diversity of the chikungunya virus in Brazil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Piauí. Piauí, PI, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Goiás. Goiania, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Alagoas. Maceió, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Carlos Chagas. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Secretaria de Saúde do Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Ezequiel Dias. Laboratório Central de Saúde Pública de Minas Gerais. Belo Horizonte, MG, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Maranhão. São Luís, MA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Pan American Health Organization (PAHO). Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Alagoas. Maceió, AL, Brasil. | en_US |
Affilliation | Department of Global Health and Medicine. University of Washington. Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. / Universidade de Pernambuco. Serra Talhada, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Maranhão. São Luís, MA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Sergipe. Aracaju, SE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Maranhão. São Luís, MA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Goiás. Goiânia, GO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Pan American Health Organization (PAHO). Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Universidade Estadual de Feira de Santana. Feira de Santana, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Mato Grosso do Sul. Campo Grande, MS, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Secretaria de Saúde de Feira de Santana. Feira de Santana, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Department of Immunology. University of Washington. Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Paraná. Curitiba, PR, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral de Arboviroses. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde e Ambiente. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Department of Environmental and Occupational Health Sciences. University of Washington. Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Affilliation | Ministério da Saúde. Coordenação Geral dos Laboratórios de Saúde Pública. Brasília, DF, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Pernambuco. Recife, PE, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Hemocentro de Ribeirão Preto. Ribeirão Preto, SP, Brasil. / Instituto Butantan. Centro de Difusão Científica. São Paulo, SP, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte. Natal, RN, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Paraíba. João Pessoa, PB, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública da Bahia. Salvador, BA, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública de Goiás. Goiania, GO, Brasil. | en_US |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Piauí. Piauí, PI, Brasil. | en_US |
Affilliation | Department of Medicine. University of Washington. Seattle, WA, USA. | en_US |
Affilliation | Pan American Health Organization (PAHO). Washington, USA. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | en_US |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto René Rachou. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciências Biológicas. Belo Horizonte, MG, Brasil. / Organização Pan-Americana da Saúde. Organização Mundial da Saúde. Brasília, Brasil. | en_US |
Subject | Chikungunya virus | en_US |
Subject | Genomics | en_US |
Subject | Public Health Surveillance | en_US |
Subject | AID APOBEC Deaminases | en_US |
Subject | Adenosine Deaminase | en |
Subject in Spanish | Virus Chikungunya | en_US |
Subject in Spanish | Genómica | en_US |
Subject in Spanish | Vigilancia en Salud Pública | en_US |
Subject in Spanish | Desaminasas APOBEC | en_US |
Subject in Spanish | Adenosina Desaminasa | es |
Subject in French | Virus du chikungunya | en_US |
Subject in French | Génomique | en_US |
Subject in French | Surveillance de la santé publique | en_US |
Subject in French | APOBEC Deaminases | en_US |
Subject in French | Adenosine deaminase | fr |
DeCS | Vírus Chikungunya | en_US |
DeCS | Genômica | en_US |
DeCS | Vigilância em Saúde Pública | en_US |
DeCS | Desaminases AID-APOBEC | en_US |
DeCS | Adenosina Desaminase | pt |