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https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/50561
AVALIAÇÃO DA RELAÇÃO GENÉTICA E PERFIL DE SENSIBILIDADE DE KLEBSIELLA PNEUMONIAE AOS CARBAPENÊMICOS E A COLISTINA EM HOSPITAL TERCIÁRIO DE SALVADOR
Rocha, Verônica de França Diniz | Date Issued:
2021
Affilliation
Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil.
Abstract in Portuguese
INTRODUÇÃO: Bactérias gram negativas multirresistentes, tais como a Klebsiella pneumoniae resistente aos carbapenêmicos e a colistina, representam um grande problema para os sistemas de saúde em todo o mundo e apresentam elevada letalidade. OBJETIVO: Avaliar a relação genética, perfil de sensibilidade antimicrobiana e mecanismos de resistência aos carbapenêmicos e à colistina em isolados de Klebsiella pneumoniae. MÉTODO: Série de casos de pacientes infectados/colonizados por cepas de Klebsiella pneumoniae resistente a carbapenêmicos e colistina (ColR-KPC) provenientes de um hospital terciário da cidade de Salvador, Bahia. No período de setembro de 2016 a janeiro de 2018 foram incluídos no estudo pacientes internados com idade igual ou superior a 18 anos. Utilizando questionário semiestruturado foram coletadas variáveis sociodemográficas e clínico-laboratoriais. Foram realizados testes fenotípicos e genotípicos em relação à resistência aos carbapenêmicos e colistina, e para verificar a disseminação dos isolados pelo hospital. RESULTADO: Foram identificadas 56 culturas de ColR-KPC pertencentes a 46 pacientes. Dados clínicos e demográficos foram obtidos de 31 pacientes. A mediana de idade foi 62, 67,7% eram homens (n=21/31), e mediana do escore de Charlson de 3. As principais comorbidades foram: hipertensão arterial sistêmica em 38,7% (n=14/31), diabetes 32,2% (n=10/31) e doença cerebrovascular em 25,8% (n=8/31). 90,6% (n=29/31) fez uso de ventilação mecânica e 93,7% (n=30/31) utilizou acesso venoso central. Dos 31 pacientes, 12 tiveram infecção por ColR-KPC e sete foram a óbito (58,4%). O uso prévio de polimixinas foi identificada em 32,2% (n=10/31) e de carbapenêmicos em 70,9% (n=22/31). Em relação aos 56 isolados, 67,8% (n=38/56) foram de swab retal, 8,9% (n=5/56) de hemoculturas, 7,1% (n=4/56) de ponta de cateter, 5,3% (n=3/56) secreção traqueal e 3,6% (n=2/56) urina. A CIM90 para colistina foi > 16 \03BCg/ml, sendo que mais da metade dos isolados (55%) tiveram a CIM de 256 \03BCg/ml. O gene blaKPC foi detectado em 92,8% dos isolados (n=52/56), blaNDM 16,0% (n=9/56) e blaGES 1,7% (n=1/56). Os genes blaOXA-48, blaVIM e blaIMP não foram detectados. A co-expressão de gene de carbapenemase foi encontrada entre blaKPC e blaNDM em 10,7%, (n=6/56), e blaKPC e blaGES em 1,7% (n=1/56). Alteração no gene mgrB foi detectado em 64,2% (n=36/56) e não-detecção em 8,9% (n=5/56). A pesquisa de mcr-1 foi negativa em todas os 56 isolados. O perfil do PFGE evidenciou perfil monoclonal em 84,7% dos isolados em diversos setores do hospital, sendo o ST-11 (CC-258) o tipo de sequência mais frequente. CONCLUSÃO: Pacientes infectados com ColR-KPC apresentaram elevada letalidade. A despeito das medidas de controle de infecção hospitalar, a transmissão horizontal parece ter contribuído para a disseminação da ColR-KPC ST-11 pelos diversos setores do hospital. Alterações/não detecção do genemgrB foram encontradas em 73,1% dos isolados, sugerindo que seja o principal mecanismo relacionado com a resistência às polimixinas neste estudo.
Abstract
INTRODUCTION: Multi-resistant gram negative bacteria, such as carbapenem and colistin-resistant Klebsiella pneumoniae represent a major problem for health systems worldwide and have high lethality. OBJECTIVE: Evaluate the genetic relationship, antimicrobial sensitivity profile and the mechanisms of resistance to carbapenems and colistin in Klebsiella pneumoniae isolates. METHOD: Series of cases of patients infected/colonized by Klebsiella pneumoniae resistant to carbapenems and colistin (ColR-KPC) strains from a tertiary hospital in the city of Salvador, Bahia. From September 2016 to January 2018, patients aged 18 years or older hospitalized were included in the study. Using a semi-structured questionnaire, sociodemographic and clinical-laboratory variables were collected. Phenotypic and genotypic tests were performed in relation to resistance to carbapenems and colistin, and to verify the spread of isolates by the hospital. RESULT: 56 ColR-KPC cultures belonging to 46 patients were identified. Clinical and demographic data were obtained from 31 patients. The median age was 62, 67.7% were men (n=21/31), and the median Charlson score was 3. The main comorbidities were: systemic arterial hypertension in 38.7% (n=14/31), diabetes 32.2% (n=10/31) and cerebrovascular disease in 25.8% (n=8/31). 90.6% (n=29/31) used mechanical ventilation and 93.7% (n=30/31) used central venous cathter. Of the 31 patients, 12 had ColR-KPC infection and seven died (58.4%). Previous use of polymyxins was identified in 32.2% (n=10/31) and carbapenems in 70.9% (n=22/31). Regarding the 56 isolates, 67.8% (n=38/56) were from rectal swabs, 8.9% (n=5/56) from blood cultures, 7.1% (n=4/56) from tip of catheter, 5.3% (n=3/56) tracheal secretion and 3.6% (n=2/56) urine. The MIC90 for colistin was > 16 \03BCg/ml, with more than half of the isolates (55%) having a MIC of 256 \03BCg/ml. The blaKPC gene was detected in 92.8% of the isolates (n=52/56), blaNDM 16.0% (n=9/56) and blaGES 1.7% (n=1/56). The blaOXA-48, blaVIM and blaIMP genes were not detected. Carbapenemase gene co-expression was found between blaKPC and blaNDM in 10.7%, (n=6/56), and blaKPC and blaGES in 1.7% (n=1/56). Changes in the mgrB gene were detected in 64.2% (n=36/56) and non-detection in 8.9% (n=5/56). The mcr-1 test was negative in all 56 isolates. The PFGE profile showed a monoclonal profile in 84.7% of the isolates in different sectors of the hospital, with ST-11 (CC-258) being the most frequent type of sequence. CONCLUSION: Patients infected with ColR-KPC had high lethality. Despite hospital infection control measures, horizontal transmission seems to have contributed to the dissemination of ColR-KPC ST-11 throughout the hospital. Alterations/non-detection of the mgrB gene were found in 73.1% of the isolates, suggesting that it is the main mechanism related to resistance topolymyxins in this study.
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