Author | Xavier, Joilson | |
Author | Fonseca, Vagner | |
Author | Bezerra, João Felipe | |
Author | Alves, Manoella do Monte | |
Author | Mares-Guia, Maria Angélica | |
Author | Claro, Ingra Morales | |
Author | Jesus, Ronaldo de | |
Author | Adelino, Talita Émile Ribeiro | |
Author | Araújo, Emerson | |
Author | Cavalcante, Karina Ribeiro Leite Jardim | |
Author | Tosta, Stephane | |
Author | Souza, Themis Rocha de | |
Author | Cruz, Flavia Emanuelle Moreira da | |
Author | Fabri, Allison de Araújo | |
Author | Oliveira, Elaine Cristina | |
Author | Moura, Noely Fabiana Oliveira de | |
Author | Said, Rodrigo Fabiano do Carmo | |
Author | Melo, Carlos Frederico Campelo de Albuquerque e | |
Author | Azevedo, Vasco | |
Author | Oliveira, Tulio de | |
Author | Filippis, Ana Maria Bispo de | |
Author | Cunha, Rivaldo Venâncio da | |
Author | Luz, Kleber Giovanni | |
Author | Giovanetti, Marta | |
Author | Alcantara, Luiz Carlos Junior | |
Access date | 2021-04-09T19:24:59Z | |
Available date | 2021-04-09T19:24:59Z | |
Document date | 2021 | |
Citation | XAVIER, Joilson et al. Chikungunya virus ECSA lineage reintroduction in the northeasternmost region of Brazil. International Journal of Infectious Diseases, v. 105, p. 120-123, 2021. | pt_BR |
ISSN | 1201-9712 | pt_BR |
URI | https://www.arca.fiocruz.br/handle/icict/46615 | |
Language | eng | pt_BR |
Publisher | Elsevier | pt_BR |
Rights | open access | |
Subject in Portuguese | Vírus chikungunya | pt_BR |
Subject in Portuguese | Linhagem ECSA | pt_BR |
Subject in Portuguese | Nordeste do Brasil | pt_BR |
Subject in Portuguese | Epidemiologia genômica | pt_BR |
Title | Chikungunya virus ECSA lineage reintroduction in the northeasternmost region of Brazil | pt_BR |
Type | Article | |
DOI | 10.1016/j.ijid.2021.01.26 | |
Abstract | The Northeast region of Brazil registered the second-highest incidence proportion of Chikungunya fever
in 2019. In that year, an outbreak consisting of patients presenting with febrile disease associated with
joint pain was reported by the public primary health care service in the city of Natal, in the state of Rio
Grande do Norte, in March 2019. At first, the aetiological agent of the disease was undetermined. Since
much is still unknown about chikungunya virus' (CHIKV) genomic diversity and evolutionary history in
this northeasternmost state, we used a combination of portable whole-genome sequencing, molecular
clock, and epidemiological analyses that revealed the reintroduction of the CHIKV East-Central-South African (ECSA) lineage into Rio Grande do Norte. We estimated that the CHIKV ECSA lineage was first
introduced into Rio Grande do Norte in early June 2014, while the 2019 outbreak clade diverged around
April 2018, during a period of increased Chikungunya incidence in the Southeast region, which might
have acted as a source of virus dispersion towards the Northeast region. Together, these results confirm
that the ECSA lineage continues to spread across the country through interregional importation events,
likely mediated by human mobility. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil / KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), University of KwaZuluNatal, Durban, South Africa. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Rio Grande do Norte Dr. Almino Fernandes. Natal, RN, Brasil / Universidade Federal da Paraíba. Escola Técnica de Saúde. PB, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Departamento de Infectologia. Natal, RN, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade de São Paulo. Faculdade de Medicina. Instituto de Medicina Tropical.São Paulo, SP, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Norte. RN, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Secretaria de Saúde do Estado do Rio Grande do Norte. RN, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Mato Grosso. Cuiabá, MT, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Organização Pan-Americana da Saúde/Organização Mundial da Saúde. Brasília, DF, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | KwaZulu-Natal Research Innovation and Sequencing Platform (KRISP), University of KwaZuluNatal, Durban, South Africa. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Fundação Oswaldo Cruz Pantanal, Campo Grande, MS, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal do Rio Grande do Norte. Departamento de Infectologia. Natal, RN, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Affilliation | Universidade Federal de Minas Gerais. Instituto de Ciencias Biológicas. Laboratório de Genética Celular e Molecular. Belo Horizonte, MG, Brasil / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Laboratório de Flavivírus. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. | pt_BR |
Subject | Chikungunya virus | pt_BR |
Subject | ECSA lineage | pt_BR |
Subject | Northeast Brazil | pt_BR |
Subject | Genomic epidemiology | pt_BR |